24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7753 on replicon NC_011889
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011889  Mnod_7753  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  333  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3826  hypothetical protein  73.46 
 
 
176 aa  246  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.800886  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0065  hypothetical protein  74.38 
 
 
170 aa  245  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0100  hypothetical protein  73.75 
 
 
170 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6425  hypothetical protein  73.38 
 
 
161 aa  209  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4671  hypothetical protein  66.41 
 
 
163 aa  174  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5944  hypothetical protein  42.94 
 
 
171 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5318  hypothetical protein  39.86 
 
 
174 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0482  hypothetical protein  36.36 
 
 
161 aa  94  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.983656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5014  hypothetical protein  38.81 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.397057  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2722  hypothetical protein  34.39 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  0.131757 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3112  hypothetical protein  36.55 
 
 
189 aa  88.6  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2422  hypothetical protein  37.33 
 
 
198 aa  88.2  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.53452  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3939  hypothetical protein  33.13 
 
 
169 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1232  hypothetical protein  37.23 
 
 
163 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1949  hypothetical protein  35.77 
 
 
164 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2574  hypothetical protein  35.04 
 
 
163 aa  84.3  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0025  hypothetical protein  36.3 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0029  hypothetical protein  36.25 
 
 
191 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85026  normal  0.998134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1796  hypothetical protein  32.85 
 
 
177 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1845  hypothetical protein  31.39 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2180  hypothetical protein  31.39 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6073  hypothetical protein  29.66 
 
 
314 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2247  hypothetical protein  28.57 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>