71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7736 on replicon NC_011888
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011888  Mnod_7736  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 86 aa  168  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7049  hypothetical protein  76.32 
 
 		 90 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6881  transcriptional regulator, XRE family  56.94 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.879707  normal  0.858405 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5911  putative transcriptional regulator, XRE family  55.56 
 
 		 105 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.432156 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4179  XRE family transcriptional regulator  56.94 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1230  helix-turn-helix domain-containing protein  50.67 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0603  XRE family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000347962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0399  XRE family transcriptional regulator  51.39 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000208338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8419  transcriptional regulator, XRE family  44.3 
 
 		 490 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.310516  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0207  XRE family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0720343  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6201  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 1350 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.692672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0335  DNA-binding protein  45.95 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3182  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447184  normal  0.0403938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7220  transcriptional regulator, XRE family  42.67 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0596093  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1506  transcriptional regulator, XRE family  47.22 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4671  hypothetical protein  38.16 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0293  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7725  hypothetical protein  37.14 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0293136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1214  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0916  putative transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0324  hypothetical protein  38.57 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.929331 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3179  XRE family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 83 aa  52  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.233031  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1303  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.840388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1531  transcriptional regulator, XRE family  44.16 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1298  hypothetical protein  40 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2449  hypothetical protein  43.84 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0976  hypothetical protein  35 
 
 		 108 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.0849399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1805  hypothetical protein  39.68 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00848511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0940  hypothetical protein  36.25 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0809559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6245  hypothetical protein  40.28 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0635069  normal  0.401828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3428  hypothetical protein  42.31 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.450139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0389  XRE family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 359 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5561  transcriptional regulator (lambda repressor-like DNA-binding domain)  39.02 
 
 		 1346 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0714  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.563976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6546  XRE family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188635  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1704  hypothetical protein  42.65 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3825  GAF domain-containing protein  37.14 
 
 		 276 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0507581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4134  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 267 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1498  hypothetical protein  41.89 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5034  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3679  hypothetical protein  38.03 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1209  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3659  hypothetical protein  38.1 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.274264  normal  0.101652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3526  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335208  normal  0.820546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3071  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3020  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0264  hypothetical protein  39.02 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.926101  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3311  XRE family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 1352 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2596  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.205995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3835  hypothetical protein  40.58 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0821585  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1517  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.788491  normal  0.176287 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1039  hypothetical protein  37.66 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0953795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  34.55 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4299  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2273  hypothetical protein  40.98 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0436574 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5172  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00460667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0329  hypothetical protein  35.9 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0612063  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2275  hypothetical protein  43.42 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5749  hypothetical protein  39.19 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2170  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5399  putative PAS/PAC sensor protein  40.98 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.686333  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2974  hypothetical protein  40.85 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0528  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 202 aa  40.8  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1782  DNA-binding protein  42.25 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.684627  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3536  helix-turn-helix domain protein  38.89 
 
 		 513 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.948286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 901 aa  40.4  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>