86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7731 on replicon NC_011888
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  100 
 
 
841 aa  1665  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  38.72 
 
 
930 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4214  hypothetical protein  35.59 
 
 
845 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.363466  normal  0.433142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  32.19 
 
 
979 aa  349  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3477  hypothetical protein  38.31 
 
 
631 aa  291  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00832403 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0070  hypothetical protein  34.74 
 
 
582 aa  289  1e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1073  hypothetical protein  34.03 
 
 
591 aa  278  2e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2917  hypothetical protein  33.56 
 
 
689 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0301646 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1626  hypothetical protein  32.3 
 
 
911 aa  273  1e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00166468  normal  0.0358334 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1225  protein of unknown function DUF927  35.24 
 
 
515 aa  272  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0207229  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0098  hypothetical protein  32.87 
 
 
950 aa  264  5e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4783  zinc-binding domain protein, primase-helicase family  32.92 
 
 
890 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0381  inner membrane protein  32.92 
 
 
890 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.401126 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2366  inner membrane protein  32.7 
 
 
958 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1754  inner membrane protein  32.7 
 
 
958 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2642  zinc-binding domain of primase-helicase family  31.79 
 
 
895 aa  261  5e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.740754  hitchhiker  6.96733e-12 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0113  hypothetical protein  32.7 
 
 
950 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0309  inner membrane protein  32.7 
 
 
955 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2484  primase 2  32.7 
 
 
953 aa  259  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04064  inner membrane protein  33.56 
 
 
580 aa  258  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2008  DNA primase  32.35 
 
 
955 aa  256  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491105  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1288  inner membrane protein  32.53 
 
 
953 aa  256  1e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2244  hypothetical protein  32.05 
 
 
658 aa  249  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.696952  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0651  hypothetical protein  32.97 
 
 
627 aa  248  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19875  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  58.26 
 
 
739 aa  246  1e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1505  hypothetical protein  32.91 
 
 
633 aa  246  2e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.618483  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2819  hypothetical protein  34.67 
 
 
676 aa  221  5e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.14645  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2096  protein of unknown function DUF927  26.14 
 
 
1051 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0990242  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0552  hypothetical protein  33.1 
 
 
574 aa  194  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0346  superfamily II helicase  31.91 
 
 
553 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.079458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3990  superfamily II helicase  32.02 
 
 
556 aa  178  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  54.17 
 
 
272 aa  170  8e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4007  protein of unknown function DUF927  31.18 
 
 
899 aa  162  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3881  P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  30.6 
 
 
929 aa  162  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0756  hypothetical protein  29.69 
 
 
711 aa  149  1e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2180  inner membrane protein  35.49 
 
 
295 aa  149  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.541049  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0680  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.62 
 
 
713 aa  142  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  1.09484e-07 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2368  protein of unknown function DUF927  30.42 
 
 
878 aa  139  3e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.124807  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2181  hypothetical protein  36.72 
 
 
280 aa  128  6e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.437951  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1691  zinc finger CHC2-family protein  35.91 
 
 
351 aa  110  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4088  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.78 
 
 
970 aa  103  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2621  Bifunctional DNA primase/polymerase  29.53 
 
 
970 aa  103  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0360  inner membrane protein  28.21 
 
 
443 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0727  hypothetical protein  37.5 
 
 
847 aa  102  4e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  41.08 
 
 
765 aa  101  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  33.9 
 
 
682 aa  98.2  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  39.53 
 
 
759 aa  92.8  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  9.88084e-05 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  38.56 
 
 
838 aa  90.9  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  37.97 
 
 
760 aa  90.9  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2613  superfamily II helicase  31.13 
 
 
987 aa  88.2  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  36.32 
 
 
712 aa  86.3  2e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  35.37 
 
 
731 aa  86.3  2e-15  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  36.32 
 
 
712 aa  85.9  3e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  36.32 
 
 
712 aa  85.9  3e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  36.84 
 
 
720 aa  85.9  3e-15  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  36.13 
 
 
716 aa  84  1e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  36.84 
 
 
712 aa  83.6  1e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1025  protein of unknown function DUF927  22.48 
 
 
842 aa  82  5e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.337392  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0257  superfamily II helicase  25.88 
 
 
580 aa  79.3  2e-13  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  40.21 
 
 
755 aa  79.7  2e-13  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  38.71 
 
 
834 aa  78.2  7e-13  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1193  protein of unknown function DUF927  27.72 
 
 
897 aa  77.8  8e-13  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.280994 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2984  superfamily II helicase  23.72 
 
 
624 aa  69.3  3e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.421436  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2423  hypothetical protein  48.15 
 
 
134 aa  68.2  7e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.419372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3088  protein of unknown function DUF927  30.1 
 
 
709 aa  66.6  2e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0049  hypothetical protein  33.33 
 
 
383 aa  65.9  3e-09  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2496  hypothetical protein  28 
 
 
597 aa  65.5  4e-09  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  36.94 
 
 
892 aa  65.1  5e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0050  hypothetical protein  30.3 
 
 
597 aa  63.9  1e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0051  hypothetical protein  30.3 
 
 
597 aa  63.9  1e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  28.34 
 
 
867 aa  58.9  4e-07  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  31.25 
 
 
654 aa  56.6  2e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2286  hypothetical protein  31.78 
 
 
125 aa  55.8  3e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  32.78 
 
 
815 aa  55.8  4e-06  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1578  Bifunctional DNA primase/polymerase  33.58 
 
 
1006 aa  53.9  1e-05  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.357329 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7197  hypothetical protein  31.76 
 
 
302 aa  53.5  2e-05  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.860673  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  33.33 
 
 
895 aa  52  4e-05  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  36.94 
 
 
278 aa  52  5e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2483  hypothetical protein  34.78 
 
 
298 aa  51.6  7e-05  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0065  hypothetical protein  34.78 
 
 
298 aa  51.6  7e-05  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  29.77 
 
 
732 aa  48.9  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2772  Bifunctional DNA primase/polymerase  28.34 
 
 
1002 aa  48.1  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  33.03 
 
 
684 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0501  hypothetical protein  24.51 
 
 
647 aa  46.6  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000301954  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  36.61 
 
 
718 aa  44.7  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  24.35 
 
 
701 aa  44.3  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>