More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7522 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  74.25 
 
 
727 aa  1057  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  56.96 
 
 
739 aa  766  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  51.68 
 
 
770 aa  651  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  59.12 
 
 
741 aa  765  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  63.87 
 
 
720 aa  790  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  53.67 
 
 
730 aa  640  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  49.24 
 
 
779 aa  639  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  90.63 
 
 
714 aa  1252  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  51.66 
 
 
723 aa  641  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  73.94 
 
 
727 aa  1054  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  59.34 
 
 
734 aa  773  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  63.79 
 
 
734 aa  779  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
714 aa  1423  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  58.91 
 
 
712 aa  779  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  75.07 
 
 
728 aa  1072  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  56.71 
 
 
757 aa  744  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  61.49 
 
 
732 aa  772  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  49.11 
 
 
776 aa  638  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  52.27 
 
 
763 aa  647  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  74.04 
 
 
728 aa  1061  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  54.66 
 
 
735 aa  758  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  57.51 
 
 
720 aa  750  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  50.08 
 
 
750 aa  632  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  51.9 
 
 
775 aa  624  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  3.21042e-11 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  50.15 
 
 
833 aa  625  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  50 
 
 
651 aa  532  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  46.57 
 
 
654 aa  506  1e-142  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  49.91 
 
 
796 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  45.18 
 
 
714 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  45.71 
 
 
691 aa  478  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  43.42 
 
 
718 aa  478  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  45.63 
 
 
669 aa  471  1e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  44.12 
 
 
768 aa  471  1e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  39.59 
 
 
764 aa  471  1e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  44.73 
 
 
724 aa  466  1e-130  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  42.58 
 
 
784 aa  468  1e-130  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  43.11 
 
 
760 aa  468  1e-130  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  42.58 
 
 
765 aa  468  1e-130  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  43.15 
 
 
724 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  44.36 
 
 
718 aa  462  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  42.79 
 
 
744 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  47.35 
 
 
656 aa  462  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  42.57 
 
 
757 aa  459  1e-128  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  48.4 
 
 
810 aa  462  1e-128  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  42.76 
 
 
759 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  43.72 
 
 
759 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  43.33 
 
 
760 aa  457  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  40.43 
 
 
712 aa  452  1e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  41.55 
 
 
758 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  41.93 
 
 
743 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  42.35 
 
 
750 aa  446  1e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  41 
 
 
742 aa  447  1e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  42.28 
 
 
769 aa  447  1e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  46.92 
 
 
830 aa  439  1e-122  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  46.59 
 
 
830 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  44.27 
 
 
658 aa  435  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  41.61 
 
 
712 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  44.17 
 
 
707 aa  435  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  44.31 
 
 
733 aa  435  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  46.1 
 
 
815 aa  434  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  41.17 
 
 
735 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  45.88 
 
 
814 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  43.81 
 
 
831 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  41.46 
 
 
732 aa  424  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  46.77 
 
 
750 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  43.81 
 
 
788 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  40.5 
 
 
776 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  41.96 
 
 
709 aa  425  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  43.49 
 
 
788 aa  422  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  44.92 
 
 
626 aa  418  1e-115  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  41.6 
 
 
729 aa  416  1e-115  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  43.06 
 
 
712 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  42.51 
 
 
728 aa  407  1e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  43.33 
 
 
727 aa  409  1e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  41.9 
 
 
763 aa  407  1e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  41.7 
 
 
643 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  42 
 
 
736 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  41.7 
 
 
643 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  39.19 
 
 
648 aa  400  1e-110  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  44.42 
 
 
626 aa  402  1e-110  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  39.62 
 
 
755 aa  402  1e-110  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  41.88 
 
 
643 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  40.22 
 
 
744 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  42.6 
 
 
776 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  43 
 
 
699 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  39.19 
 
 
626 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  40.27 
 
 
751 aa  389  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  40.9 
 
 
824 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  40.73 
 
 
824 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  39.23 
 
 
811 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  41.57 
 
 
618 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  40.77 
 
 
765 aa  385  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  40.71 
 
 
625 aa  381  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  38.51 
 
 
683 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  42.05 
 
 
761 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  40.11 
 
 
661 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  40.18 
 
 
654 aa  372  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  37.99 
 
 
648 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  38.17 
 
 
668 aa  361  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  39.1 
 
 
646 aa  359  8e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.46416e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>