273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7448 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7448  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
240 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.526789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6709  6-phosphogluconolactonase  78.75 
 
 
239 aa  341  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.171628  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  67.78 
 
 
241 aa  297  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  65.7 
 
 
243 aa  260  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  60.17 
 
 
243 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  60.17 
 
 
243 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  57.33 
 
 
429 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  55.79 
 
 
235 aa  234  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  55.93 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  54.55 
 
 
242 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  53.45 
 
 
246 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  52.84 
 
 
248 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  50.64 
 
 
248 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  48.09 
 
 
245 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  44.07 
 
 
241 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  48.57 
 
 
240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1273  6-phosphogluconolactonase  44.81 
 
 
245 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.169583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  41.63 
 
 
252 aa  154  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  42.56 
 
 
242 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  40.83 
 
 
236 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  40.76 
 
 
236 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  40.34 
 
 
248 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16881  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  41.53 
 
 
236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.379961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  41.51 
 
 
241 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  38.49 
 
 
239 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  39.9 
 
 
241 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  40.5 
 
 
238 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  47.89 
 
 
242 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  40.42 
 
 
240 aa  138  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  36.75 
 
 
235 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1225  6-phosphogluconolactonase  41.55 
 
 
245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.277313  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2420  6-phosphogluconolactonase  48.39 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.245998  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1257  6-phosphogluconolactonase  41.55 
 
 
237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  41.04 
 
 
262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2698  6-phosphogluconolactonase  36.51 
 
 
241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.448278  normal  0.149935 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2507  6-phosphogluconolactonase  49.31 
 
 
243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2488  6-phosphogluconolactonase  41.58 
 
 
265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  34.82 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  37.55 
 
 
240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  43.52 
 
 
252 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09911  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  38.97 
 
 
237 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0857733  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1131  6-phosphogluconolactonase  41.91 
 
 
248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  38.59 
 
 
240 aa  125  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  33.61 
 
 
225 aa  123  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  34.91 
 
 
277 aa  122  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1440  6-phosphogluconolactonase  49.2 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.217732  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3178  6-phosphogluconolactonase  38.11 
 
 
245 aa  118  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  36.67 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  36.67 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  36.67 
 
 
245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  32.3 
 
 
244 aa  115  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  35.17 
 
 
238 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0308  6-phosphogluconolactonase  36 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000090157 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  35.95 
 
 
249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  40.4 
 
 
235 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  40.4 
 
 
235 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0945  6-phosphogluconolactonase  38.96 
 
 
249 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36519  normal  0.244402 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2149  6-phosphogluconolactonase  35.22 
 
 
272 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1324  6-phosphogluconolactonase  34.26 
 
 
271 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.307725  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  31.56 
 
 
241 aa  111  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  28.89 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  35.78 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0412  6-phosphogluconolactonase  34.17 
 
 
245 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  34.63 
 
 
246 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  35.95 
 
 
247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  35.19 
 
 
373 aa  108  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  36.4 
 
 
261 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  43.54 
 
 
225 aa  109  5e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  36.75 
 
 
246 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1596  6-phosphogluconolactonase  35.5 
 
 
220 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  31.31 
 
 
238 aa  108  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  35.22 
 
 
260 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  32.16 
 
 
274 aa  108  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  40.78 
 
 
233 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  32.77 
 
 
238 aa  106  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  32.35 
 
 
238 aa  106  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  31.36 
 
 
240 aa  105  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1662  6-phosphogluconolactonase  30.91 
 
 
220 aa  105  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0177  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
238 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  37.71 
 
 
228 aa  103  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2482  6-phosphogluconolactonase  37.4 
 
 
303 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  39.41 
 
 
232 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  35 
 
 
241 aa  101  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08091  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  32.5 
 
 
238 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.212861  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  35.19 
 
 
256 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2481  6-phosphogluconolactonase  42.08 
 
 
218 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.603266  normal  0.14233 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  33.17 
 
 
214 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08331  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  31.33 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.831569  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08311  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  31.62 
 
 
245 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.29816  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  34.98 
 
 
494 aa  96.7  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08121  putative 6-phosphogluconolactonase (DevB, Pgl)  29.79 
 
 
244 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1586  6-phosphogluconolactonase  34.55 
 
 
254 aa  95.9  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1243  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.91 
 
 
280 aa  95.5  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  36.29 
 
 
279 aa  95.5  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2071  6-phosphogluconolactonase  36.19 
 
 
232 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834551  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0779  6-phosphogluconolactonase  31.2 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  34.27 
 
 
262 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  35.91 
 
 
254 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5191  6-phosphogluconolactonase  39.3 
 
 
259 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>