More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7378 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6632  carbonate dehydratase  90.62 
 
 		 225 aa  417  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  62.28 
 
 		 228 aa  287  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  64.36 
 
 		 221 aa  281  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  57.02 
 
 		 228 aa  264  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  57.02 
 
 		 228 aa  264  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  60.98 
 
 		 216 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  61.24 
 
 		 214 aa  260  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  57.89 
 
 		 214 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1829  carbonic anhydrase, putative  59.42 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.486223  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1074  carbonate dehydratase  59.22 
 
 		 214 aa  245  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.370997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  58.25 
 
 		 214 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3185  carbonate dehydratase  59.02 
 
 		 215 aa  244  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  59.02 
 
 		 214 aa  241  9e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0351  Carbonate dehydratase  59.05 
 
 		 241 aa  241  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  58.54 
 
 		 213 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3223  carbonic anhydrase  60.49 
 
 		 214 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4366  carbonate dehydratase  55.24 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4235  Carbonate dehydratase  57.56 
 
 		 213 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200227 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  54.03 
 
 		 218 aa  231  5e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3592  carbonate dehydratase  56.04 
 
 		 220 aa  231  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2792  carbonic anhydrase  56.04 
 
 		 216 aa  226  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.156635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1187  carbonate dehydratase  55.39 
 
 		 242 aa  225  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.980271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0240  carbonate dehydratase  48.29 
 
 		 210 aa  193  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.615218  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  48.79 
 
 		 218 aa  187  9e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1282  carbonate dehydratase  49.27 
 
 		 213 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.95303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  47 
 
 		 211 aa  177  8e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  45.93 
 
 		 213 aa  176  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  46.67 
 
 		 216 aa  175  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  47.55 
 
 		 255 aa  175  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  45.1 
 
 		 210 aa  174  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  40.2 
 
 		 210 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  43.63 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1920  carbonate dehydratase  45.37 
 
 		 224 aa  169  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3457  carbonate dehydratase  43.81 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1165  carbonate dehydratase  44.66 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.623319  normal  0.0416937 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1969  carbonic anhydrase  39.71 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00238162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0227  carbonate dehydratase  39.71 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000228085  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3236  carbonate anhydratase  44.76 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0036  carbonate dehydratase  44.44 
 
 		 214 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0045  carbonate dehydratase  44.98 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1377  carbonic anhydrase  44.98 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  37.25 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  44.21 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  42.79 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  36.82 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1665  carbonic anhydrase  41.59 
 
 		 238 aa  151  8e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.705722  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  40.67 
 
 		 216 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  38.24 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  38.24 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  40.09 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  35.64 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  33.99 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  34.5 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  34.5 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  37.86 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  39.71 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  36.27 
 
 		 210 aa  144  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8182  Zn carbonic anhydrase  43.78 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.249674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  38.97 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  39.9 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  40.62 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  35.44 
 
 		 216 aa  138  8.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  34.74 
 
 		 200 aa  137  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  33.01 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  39.9 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  40.61 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  40.61 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  38.76 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  39.63 
 
 		 228 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  35.85 
 
 		 236 aa  134  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  37.07 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  38.99 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  38.99 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  36.68 
 
 		 211 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  41.33 
 
 		 739 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  38.53 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  33.18 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  38.53 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  38.53 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  38.53 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  36.28 
 
 		 267 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  36.28 
 
 		 267 aa  128  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  39.5 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  34.13 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  36.62 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  36.18 
 
 		 211 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  35.9 
 
 		 278 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  35.62 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  35.62 
 
 		 242 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  35.81 
 
 		 219 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1281  carbonate dehydratase  35.53 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.606633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  33.17 
 
 		 233 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  35.68 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  34.48 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  32.74 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  34.48 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  35.51 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>