49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7282 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7282  thiamine monophosphate synthase  100 
 
 		 234 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00853533  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6005  thiamine monophosphate synthase  74.12 
 
 		 230 aa  284  9e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00666288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0155  thiamine monophosphate synthase  61.27 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2326  thiamine monophosphate synthase  59.55 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.762723  normal  0.234321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2370  thiamine monophosphate synthase  61.2 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.467805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2647  thiamine monophosphate synthase  60.66 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.19208  normal  0.895196 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2738  thiamine monophosphate synthase  42.37 
 
 		 233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.621055  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4318  thiamine monophosphate synthase  48.52 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  0.404897 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0313  thiamine monophosphate synthase  41.94 
 
 		 210 aa  123  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1009  thiamine monophosphate synthase  42.78 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6930  putative thiamine phosphate pyrophosphorylase (thiamin phosphate synthase/diphosphorylase)  42.36 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.287069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4774  thiamine monophosphate synthase  41.11 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3535  thiamine monophosphate synthase  42.69 
 
 		 233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3522  thiamine monophosphate synthase  41.04 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.852533  normal  0.110459 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4472  thiamine monophosphate synthase  45.68 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1650  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.81 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.694327  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.81 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1962  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.23 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247513  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3182  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.91 
 
 		 219 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.442853  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1208  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.45 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3269  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.44 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.706731 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3078  thiamine monophosphate synthase  45.98 
 
 		 208 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.657942  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1315  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.68 
 
 		 216 aa  99.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.706384 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3675  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.83 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3568  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.02 
 
 		 217 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0666672 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0381  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.62 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.5 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3151  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.95 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2104  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.14 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.245468  normal  0.0211222 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  29.05 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.65 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.694137  normal  0.669772 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2667  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.28 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.324965 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  33.97 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0750  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.2 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.851867 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2434  thiamine monophosphate synthase  35.86 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  0.0278074 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3521  thiamine monophosphate synthase  34.1 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.223937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3697  thiamine monophosphate synthase  34.56 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3828  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.42 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3809  hypothetical protein  34.16 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1337  thiamine monophosphate synthase  31.19 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1514  putative thiamine monophosphate synthase  32.67 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176973  normal  0.661012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.81 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.3 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1531  thiamine monophosphate synthase  26.17 
 
 		 212 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0220  putative thiamine-phosphate pyrophosphorylase  26.04 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.615766  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.17 
 
 		 346 aa  43.9  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.58 
 
 		 352 aa  42.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  34.72 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.82 
 
 		 234 aa  42  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>