More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7278 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  557  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  85 
 
 		 280 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  56.25 
 
 		 274 aa  298  7e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  56.88 
 
 		 274 aa  298  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  56.04 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  60.63 
 
 		 271 aa  291  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  56.04 
 
 		 272 aa  291  7e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  59.78 
 
 		 279 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  60.66 
 
 		 273 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  59.11 
 
 		 276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  60.74 
 
 		 276 aa  282  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  55.22 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  58.7 
 
 		 279 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  59.42 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  53.14 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  52.03 
 
 		 276 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  52.77 
 
 		 276 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  51.13 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  49.45 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  50.56 
 
 		 286 aa  235  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  51.66 
 
 		 276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  52.01 
 
 		 276 aa  231  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  53.01 
 
 		 279 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  51.13 
 
 		 275 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  49.82 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  56.22 
 
 		 286 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  49.26 
 
 		 267 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  50.91 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  49.25 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  51.27 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  49.03 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  51.27 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  51.27 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  47.48 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  47.84 
 
 		 274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  50.75 
 
 		 286 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  52.36 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  45.95 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  51.5 
 
 		 286 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  43.22 
 
 		 276 aa  185  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  47.47 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  44.94 
 
 		 281 aa  178  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  40.6 
 
 		 287 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  47.1 
 
 		 276 aa  168  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  43.43 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  44 
 
 		 274 aa  155  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  41.53 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  40.08 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  30.22 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  33.21 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  29.24 
 
 		 274 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  38.49 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  38.77 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  34.66 
 
 		 268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  39.06 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  34.84 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  36.1 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  41.15 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  26.47 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.45 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  36.91 
 
 		 256 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  42.02 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  36.05 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  27.99 
 
 		 289 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  35.65 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  36.33 
 
 		 289 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  33.21 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.46 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  32.51 
 
 		 282 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  36.63 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  30.86 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  29.41 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  30.8 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  33.04 
 
 		 282 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  33.04 
 
 		 282 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  33.04 
 
 		 277 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  32.61 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  35.32 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  33.48 
 
 		 253 aa  95.1  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  37.8 
 
 		 260 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  37.02 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  26.72 
 
 		 258 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2645  PEP phosphonomutase  39.83 
 
 		 295 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.327181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2024  hypothetical protein  32.77 
 
 		 274 aa  90.5  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0525538 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  34.84 
 
 		 258 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  34.15 
 
 		 425 aa  88.6  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  30.71 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1447  PEP phosphonomutase and related enzymes  37.4 
 
 		 249 aa  86.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.792098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1856  hypothetical protein  32.24 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000480494 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  31.78 
 
 		 255 aa  86.3  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  29.53 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3426  hypothetical protein  28.63 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  34.9 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  28.01 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  34.21 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0246  hypothetical protein  32.77 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0266  hypothetical protein  32.77 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.235193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0256  hypothetical protein  32.77 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.799893  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  32.58 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0289  hypothetical protein  33.76 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>