More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7256 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 218 aa  434  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  87.1 
 
 		 251 aa  374  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  70.32 
 
 		 223 aa  289  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  70.32 
 
 		 223 aa  289  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  70.32 
 
 		 223 aa  265  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  70.97 
 
 		 217 aa  265  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  58.29 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  58.57 
 
 		 224 aa  241  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  59.53 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  57.28 
 
 		 240 aa  232  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  55.24 
 
 		 216 aa  224  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  54.29 
 
 		 216 aa  223  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  54.98 
 
 		 220 aa  221  6e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  53.81 
 
 		 218 aa  221  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  52.86 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  53.37 
 
 		 221 aa  204  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  52.91 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  48.57 
 
 		 218 aa  188  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  48.72 
 
 		 237 aa  187  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  49.23 
 
 		 231 aa  181  7e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  48.72 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  48.72 
 
 		 228 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  57.79 
 
 		 225 aa  180  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  48.72 
 
 		 230 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  50.26 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  42.44 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  47.42 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  43.13 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  45.1 
 
 		 223 aa  158  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  46.12 
 
 		 227 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  45.73 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 224 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 234 aa  131  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  43.43 
 
 		 224 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  41.08 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 248 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3723  GntR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 216 aa  121  7e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.504621 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 254 aa  118  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  38.35 
 
 		 241 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 225 aa  118  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  37.57 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  40.74 
 
 		 237 aa  115  5e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  40.21 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 234 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 240 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2915  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4868  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.37214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 239 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  36.87 
 
 		 230 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 233 aa  107  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 262 aa  105  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  39.69 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  36.56 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>