55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7200 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7200  transcriptional regulator, PaaX family  100 
 
 		 292 aa  564  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.803046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  52.65 
 
 		 293 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 305 aa  236  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0692  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  45.49 
 
 		 287 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.717402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 307 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2610  PaaX family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 334 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218497  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3286  PaaX family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.17765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2473  PaaX family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 334 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.303711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1514  transcriptional regulator, PaaX family  37.42 
 
 		 316 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0094  PaaX family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.339453  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0386  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  35.69 
 
 		 352 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000187716  normal  0.0170462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1521  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  34.98 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  38.19 
 
 		 319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3357  transcriptional regulator, PaaX family  39.02 
 
 		 301 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1585  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  35.64 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2246  transcriptional regulator, PaaX family  35.64 
 
 		 316 aa  153  4e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218129  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2256  PaaX family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1486  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  35.64 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3734  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  37.41 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0661  PaaX domain-containing protein, C- domain  28.07 
 
 		 285 aa  142  6e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0216  PaaX family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 311 aa  135  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0165647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  30.04 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4812  PaaX domain-containing protein  37.89 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.33483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 272 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  26.38 
 
 		 285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  34.63 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  32.49 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  31.1 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0703  transcriptional regulator, PaaX family  29.46 
 
 		 259 aa  85.5  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  29.07 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3828  PaaX family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648927  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  31.4 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  30.31 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0436  PaaX-like  30.96 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.581976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  27.46 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  28.81 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0309  transcriptional regulator, PaaX family  29.32 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2150  transcriptional regulator, PaaX family  29.5 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933136  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1685  PaaX family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0710641  normal  0.260669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5523  transcriptional regulator, PaaX family  31.33 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.543092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  29.55 
 
 		 260 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0289  transcriptional regulator, PaaX family  29.75 
 
 		 280 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.010887  hitchhiker  0.0000784974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  28.79 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  27.42 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0659  PaaX-like  27.16 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.702789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3784  putative transcriptional regulator, PaaX family  30.56 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1005  PaaX domain-containing protein, C- domain  29.17 
 
 		 243 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0995  PaaX domain-containing protein, C- domain  29.17 
 
 		 243 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0977  PaaX-like protein  29.17 
 
 		 243 aa  42.7  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>