More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7173 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7173  GTP cyclohydrolase I  100 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.418482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6320  GTP cyclohydrolase I  95.89 
 
 		 219 aa  434  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0252905  hitchhiker  0.00245431 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2222  GTP cyclohydrolase I  68.15 
 
 		 269 aa  333  9e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0899114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2540  GTP cyclohydrolase I  68.15 
 
 		 269 aa  331  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.131431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2265  GTP cyclohydrolase I  68.15 
 
 		 269 aa  331  6e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254544  normal  0.204953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4639  GTP cyclohydrolase I  81.38 
 
 		 272 aa  322  3e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0432586 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1004  GTP cyclohydrolase I  65.02 
 
 		 222 aa  294  7e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0356  GTP cyclohydrolase I  66.82 
 
 		 213 aa  289  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0218515 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1576  GTP cyclohydrolase I  63.18 
 
 		 213 aa  287  7e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.191303  normal  0.0635518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1649  GTP cyclohydrolase I  68.42 
 
 		 242 aa  280  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.993885  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1075  GTP cyclohydrolase I  65.79 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.76008  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1041  GTP cyclohydrolase I  65.79 
 
 		 213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.25698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2207  GTP cyclohydrolase I  62.84 
 
 		 201 aa  267  1e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.137028  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1049  GTP cyclohydrolase I  62.96 
 
 		 205 aa  265  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.399467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2158  GTP cyclohydrolase I  67.74 
 
 		 213 aa  264  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284755  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2664  GTP cyclohydrolase I  61.66 
 
 		 222 aa  263  2e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0491858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1329  GTP cyclohydrolase I  54.39 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1657  GTP cyclohydrolase I  64.52 
 
 		 234 aa  254  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2660  GTP cyclohydrolase I  63.49 
 
 		 212 aa  254  9e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00979899  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2184  GTP cyclohydrolase I  54.98 
 
 		 229 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0182088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2049  GTP cyclohydrolase I  65.97 
 
 		 204 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5183  GTP cyclohydrolase I  55.22 
 
 		 232 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.58549  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1849  GTP cyclohydrolase I  65.97 
 
 		 204 aa  251  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254954  normal  0.0136517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3872  GTP cyclohydrolase I  61.7 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3114  GTP cyclohydrolase I  52.99 
 
 		 234 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.532138 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4310  GTP cyclohydrolase I  58.33 
 
 		 212 aa  248  5e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.208107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0644  GTP cyclohydrolase I  57.37 
 
 		 206 aa  247  1e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.343443  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0271  GTP cyclohydrolase I  61.26 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3248  GTP cyclohydrolase I  60.64 
 
 		 229 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.182392  normal  0.472848 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0641  GTP cyclohydrolase  59.14 
 
 		 212 aa  244  6e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104084 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4454  GTP cyclohydrolase I  58.92 
 
 		 209 aa  244  6e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.402948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3132  GTP cyclohydrolase I  57.44 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5014  GTP cyclohydrolase I  56.41 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.386359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3155  GTP cyclohydrolase I  56.41 
 
 		 209 aa  241  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5291  GTP cyclohydrolase I  56.92 
 
 		 209 aa  240  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5116  GTP cyclohydrolase I  56.19 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19568  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5743  GTP cyclohydrolase I  56.19 
 
 		 211 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4480  GTP cyclohydrolase I  55.67 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0043  GTP cyclohydrolase I  57.45 
 
 		 258 aa  238  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0043  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0064  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 		 236 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0051  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 		 292 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1549  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 		 292 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0053  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 		 292 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1197  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 		 292 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.980634  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1480  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 		 292 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.668242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4530  GTP cyclohydrolase I  60.75 
 
 		 213 aa  237  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2399  GTP cyclohydrolase I  56.38 
 
 		 205 aa  237  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6827  GTP cyclohydrolase I  58.92 
 
 		 211 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1238  GTP cyclohydrolase I  62.64 
 
 		 205 aa  234  7e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0242  GTP cyclohydrolase I  55.5 
 
 		 206 aa  231  5e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.850043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3739  GTP cyclohydrolase I  55.38 
 
 		 190 aa  223  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2960  GTP cyclohydrolase  50.71 
 
 		 206 aa  223  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0990  GTP cyclohydrolase I  53.55 
 
 		 203 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03535  GTP cyclohydrolase I  55.19 
 
 		 190 aa  219  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4006  GTP cyclohydrolase I  55.19 
 
 		 203 aa  219  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.580102  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0871  GTP cyclohydrolase I  53.01 
 
 		 203 aa  218  6e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2007  GTP cyclohydrolase  54.27 
 
 		 204 aa  218  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.39333  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4064  GTP cyclohydrolase I  56.91 
 
 		 197 aa  217  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.999809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1597  GTP cyclohydrolase I  50.97 
 
 		 213 aa  212  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.874876  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0582  GTP cyclohydrolase  52.79 
 
 		 206 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.931041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3635  GTP cyclohydrolase  56.35 
 
 		 192 aa  210  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1230  GTP cyclohydrolase  55.56 
 
 		 211 aa  208  6e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.112784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1911  GTP cyclohydrolase I  56.25 
 
 		 200 aa  207  8e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0594  GTP cyclohydrolase I  54.64 
 
 		 190 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0811  GTP cyclohydrolase I  48.66 
 
 		 188 aa  201  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000676289  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1832  GTP cyclohydrolase  54.7 
 
 		 210 aa  201  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0912  GTP cyclohydrolase I  46.51 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0939  GTP cyclohydrolase I  46.51 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3367  GTP cyclohydrolase I  45.85 
 
 		 235 aa  199  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0402  GTP cyclohydrolase I  51.58 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.160762  normal  0.817545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2537  GTP cyclohydrolase I  47.03 
 
 		 235 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3350  GTP cyclohydrolase I  49.26 
 
 		 247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0969  GTP cyclohydrolase  46.4 
 
 		 243 aa  198  6e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0257975  normal  0.517316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1233  GTP cyclohydrolase I  50.82 
 
 		 186 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.520451  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0372  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.884596  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2203  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 187 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0553  GTP cyclohydrolase I  52.81 
 
 		 188 aa  194  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0408  GTP cyclohydrolase  50.82 
 
 		 185 aa  194  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.503604  normal  0.0142935 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0859  GTP cyclohydrolase I  53.37 
 
 		 219 aa  194  8.000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.765891  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0466  GTP cyclohydrolase I  52.78 
 
 		 188 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1116  GTP cyclohydrolase I  47.31 
 
 		 187 aa  194  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0976  GTP cyclohydrolase I  49.49 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.49412  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0193  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0560  GTP cyclohydrolase I  52.46 
 
 		 198 aa  191  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1234  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 189 aa  191  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00505478  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1858  GTP cyclohydrolase I  51.96 
 
 		 218 aa  191  8e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1363  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 188 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.0760374 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20920  GTP cyclohydrolase I  52.49 
 
 		 195 aa  191  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1638  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00226958  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1435  GTP cyclohydrolase I  50.27 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0775791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1421  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0305505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1393  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000458724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1393  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000162982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1674  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000600048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3778  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1532  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0324228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1567  GTP cyclohydrolase I  49.73 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11630  GTP cyclohydrolase I  50 
 
 		 198 aa  189  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24880  GTP cyclohydrolase I  48.9 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>