More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7084 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  100 
 
 
301 aa  598  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  80.74 
 
 
302 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  63.2 
 
 
333 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  55.92 
 
 
316 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  61.85 
 
 
314 aa  338  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  62.69 
 
 
331 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  64.31 
 
 
323 aa  329  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  46.05 
 
 
312 aa  300  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  53.36 
 
 
271 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  53.41 
 
 
310 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  49.06 
 
 
309 aa  278  9e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  47.47 
 
 
305 aa  276  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  48.63 
 
 
308 aa  277  2e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  48.05 
 
 
309 aa  276  4e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  48.05 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  47.35 
 
 
306 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  47.72 
 
 
317 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  50.97 
 
 
307 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  50.56 
 
 
305 aa  268  8e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  52.08 
 
 
311 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  49.82 
 
 
317 aa  264  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  47.84 
 
 
307 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  47.37 
 
 
302 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  47.55 
 
 
303 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  48.16 
 
 
302 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  48.87 
 
 
305 aa  256  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  48.84 
 
 
272 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  47.33 
 
 
303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  47.79 
 
 
304 aa  246  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  44 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  46.07 
 
 
301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  48.47 
 
 
277 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  39.54 
 
 
345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  38.31 
 
 
271 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1382  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  34.78 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2068  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.99 
 
 
282 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1399  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.99 
 
 
282 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0161673 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1887  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.99 
 
 
282 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0335857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1415  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.99 
 
 
282 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111165  normal  0.725362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1673  aldo/keto reductase  32.06 
 
 
284 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3081  aldo/keto reductase  32.7 
 
 
277 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3181  aldo/keto reductase  33.07 
 
 
281 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000770886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0553  aldo/keto reductase  31.97 
 
 
281 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0509974 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0138  aldo/keto reductase  32.73 
 
 
279 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0784  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.89 
 
 
281 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.756682  normal  0.970145 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0706  aldo/keto reductase  26.52 
 
 
284 aa  94.7  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000923637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2005  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.14 
 
 
284 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.537147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1156  aldo/keto reductase  33.82 
 
 
296 aa  94  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.721286  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2369  aldo/keto reductase  28.85 
 
 
294 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2505  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.77 
 
 
284 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00223283  normal  0.840205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2824  putative aldo/keto reductase  29.41 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3732  aldo/keto reductase  31.11 
 
 
273 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  35.78 
 
 
342 aa  92.8  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  26.28 
 
 
281 aa  92.4  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  34.98 
 
 
280 aa  92.4  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1919  aldo/keto reductase  32.14 
 
 
281 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2555  aldo/keto reductase  32.14 
 
 
281 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324951 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2531  aldo/keto reductase  32.14 
 
 
281 aa  92.4  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0383161  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3054  aldo/keto reductase  32.68 
 
 
284 aa  92  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00284405  normal  0.275576 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01750  predicted oxidoreductase  30.04 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.725881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1861  aldo/keto reductase  30.04 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000447998  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1866  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.04 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00718625  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0755  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
281 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.181791  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1851  aldo/keto reductase  30.04 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0581012  hitchhiker  0.000414581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  28.57 
 
 
410 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  29.45 
 
 
399 aa  90.9  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01738  hypothetical protein  30.04 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2217  aldo/keto reductase  30.65 
 
 
283 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2415  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1410  aldo/keto reductase family oxidoreductase  30.4 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2029  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.77 
 
 
284 aa  90.5  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.848992  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1997  aldo/keto reductase  28.88 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2449  aldo/keto reductase  31.87 
 
 
281 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000271935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5289  aldo/keto reductase  31.45 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  29.43 
 
 
406 aa  88.2  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2579  aldo/keto reductase  31.47 
 
 
281 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1308  aldo/keto reductase  26.94 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0142  aldo/keto reductase  29.84 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5799  aldo/keto reductase  32.71 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.384289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3226  aldo/keto reductase  29.04 
 
 
277 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.593826  normal  0.135876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  28.99 
 
 
281 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2256  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.14 
 
 
281 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1101  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.14 
 
 
281 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.16541  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1975  aldo/keto reductase  29.89 
 
 
284 aa  86.7  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0551  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.14 
 
 
286 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0948  aldo/keto reductase family oxidoreductase  33.2 
 
 
286 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2128  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.14 
 
 
286 aa  86.3  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0952  aldo/keto reductase family oxidoreductase  32.14 
 
 
281 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0530373  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  30.91 
 
 
274 aa  86.3  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  28.94 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  28 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0764  aldo/keto reductase  32.02 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000421466 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5863  aldo/keto reductase  31.08 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3195  aldo/keto reductase  32.31 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  26.3 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0715  aldo/keto reductase  31.68 
 
 
282 aa  82.8  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2881  aldo/keto reductase  31.02 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  28.47 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  34.13 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  27.86 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>