More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6962 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6962  integrase family protein  100 
 
 		 327 aa  669    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  40.39 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  39.87 
 
 		 396 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1565  phage integrase  37.85 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1727  phage integrase  38.04 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1637  integrase  45.91 
 
 		 174 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  29.8 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  30.67 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  29.04 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  28.81 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  28.4 
 
 		 341 aa  82  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  26.06 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  25.82 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  25.37 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  27.56 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  29.53 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  29.53 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  25.76 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  29.61 
 
 		 351 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  29.84 
 
 		 404 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  25.76 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  28.57 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  27.83 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  29.06 
 
 		 351 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  28.42 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  29.2 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  29.2 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  28.57 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  28.89 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  25.69 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  24.65 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1136  phage integrase family protein  34.16 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  27.52 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  32 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  28.28 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  41.54 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  26.4 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  28.04 
 
 		 401 aa  59.7  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  29.73 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  29.73 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  29.73 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  29.73 
 
 		 369 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  26.87 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.22 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  27.73 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  27.47 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  27.47 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.67 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.69 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  25.66 
 
 		 375 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  29.82 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  28.4 
 
 		 343 aa  57  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  27.76 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30 
 
 		 397 aa  56.2  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  30.66 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  24.63 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  24.3 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  25 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  28.65 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  24.04 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  31.51 
 
 		 421 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  37.39 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  38.46 
 
 		 402 aa  53.9  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  25.86 
 
 		 354 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  25 
 
 		 334 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  25.86 
 
 		 354 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  44.83 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  30.6 
 
 		 414 aa  52.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  27.18 
 
 		 354 aa  52.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  44.62 
 
 		 411 aa  52.8  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  26.69 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  29.59 
 
 		 159 aa  52.4  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.01 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  37.8 
 
 		 210 aa  52.4  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  26.72 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.12 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  26.75 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.1 
 
 		 353 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  28.04 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  37.7 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  25.3 
 
 		 298 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  27.52 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.79 
 
 		 307 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  36.36 
 
 		 384 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  26.73 
 
 		 444 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  30.38 
 
 		 198 aa  50.4  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  27.88 
 
 		 354 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  26.61 
 
 		 333 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  28.93 
 
 		 188 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2283  phage integrase family protein  34.52 
 
 		 331 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  26.32 
 
 		 386 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  36.92 
 
 		 329 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  25.93 
 
 		 396 aa  50.1  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  32.39 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0767  integrase family protein  34.15 
 
 		 371 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0883457 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  28.44 
 
 		 365 aa  49.7  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  37.5 
 
 		 210 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  34.15 
 
 		 368 aa  49.3  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>