More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6884 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  100 
 
 
215 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  80.95 
 
 
225 aa  348  4e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4178  cytochrome c oxidase, subunit III  61.35 
 
 
211 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0026  cytochrome c oxidase subunit III  56.95 
 
 
229 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.471967 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0224  cytochrome c oxidase subunit III  54.34 
 
 
229 aa  229  2e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0168  cytochrome c oxidase subunit III  53.88 
 
 
229 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0413962 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6231  cytochrome c oxidase subunit III  56.16 
 
 
225 aa  208  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211629  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  44.5 
 
 
214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  47.24 
 
 
209 aa  170  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  44.55 
 
 
224 aa  161  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  39.22 
 
 
234 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  41.92 
 
 
226 aa  145  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  38.42 
 
 
209 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5946  cytochrome c oxidase subunit III  39.02 
 
 
211 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  38.92 
 
 
209 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  38.92 
 
 
209 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1520  cytochrome c oxidase subunit III  39.66 
 
 
259 aa  141  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.34828  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  40.89 
 
 
219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  37.09 
 
 
229 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  40.4 
 
 
199 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  38.46 
 
 
235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  37.84 
 
 
234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  38.01 
 
 
234 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  35.57 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  40.53 
 
 
196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  31.69 
 
 
262 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  38.38 
 
 
199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  35.24 
 
 
211 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  40.3 
 
 
199 aa  121  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  40.1 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  41.24 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  40.31 
 
 
198 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2527  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit III  40.84 
 
 
201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00772107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0826  cytochrome c oxidase subunit III  35.94 
 
 
215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648896  normal  0.196045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0250  cytochrome c oxidase, subunit III  39.18 
 
 
200 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.256401  normal  0.022866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  34.53 
 
 
203 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  35.89 
 
 
832 aa  102  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  33.33 
 
 
819 aa  99.8  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  35.14 
 
 
194 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  33 
 
 
825 aa  97.1  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  33.66 
 
 
827 aa  95.5  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2591  cytochrome c oxidase subunit III  31.44 
 
 
239 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0750722  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2342  cytochrome c oxidase subunit III  32.65 
 
 
225 aa  95.1  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  32.07 
 
 
204 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0519  cytochrome c oxidase subunit III  31.05 
 
 
224 aa  93.2  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0892634  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2428  cytochrome c oxidase subunit III  30.83 
 
 
240 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2265  cytochrome c oxidase subunit III  31.03 
 
 
239 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.06442  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2361  cytochrome c oxidase subunit III  29.57 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0513  cytochrome c oxidase subunit III  32.09 
 
 
202 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  32.43 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0729  cytochrome c oxidase, subunit III  30.73 
 
 
236 aa  89.4  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  30.73 
 
 
950 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3635  cytochrome-C oxidase subunit III oxidoreductase protein  32.47 
 
 
231 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.074977  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  34.05 
 
 
184 aa  89  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  30.73 
 
 
974 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  30.73 
 
 
962 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  31.94 
 
 
202 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3958  cytochrome c oxidase subunit III  32.47 
 
 
234 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.178096 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0251  cytochrome c oxidase subunit III  34.42 
 
 
248 aa  86.3  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00348503 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  30.2 
 
 
200 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  30.81 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  31.91 
 
 
203 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  26.83 
 
 
243 aa  84.7  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  29.89 
 
 
209 aa  84.7  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3895  cytochrome c oxidase subunit III  29.56 
 
 
240 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  35.87 
 
 
184 aa  84.3  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  29.89 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  29.89 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  29.89 
 
 
209 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0106  cytochrome c oxidase subunit III  30.45 
 
 
208 aa  82.8  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3991  cytochrome c oxidase subunit III  41.13 
 
 
305 aa  83.2  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.632363  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  30.48 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  29.35 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0305  cytochrome c oxidase subunit III  34.38 
 
 
283 aa  82.8  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.418473  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  29.35 
 
 
209 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  32.97 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  32.97 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5127  cytochrome c oxidase subunit III  30.28 
 
 
234 aa  82  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  32.97 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  32.97 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  32.97 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  32.97 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2777  cytochrome c oxidase, subunit III  29.47 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.735853 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3970  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.52 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.713529  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2267  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  28.5 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  28.34 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  26.13 
 
 
199 aa  79.3  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2477  cytochrome c oxidase, subunit III  29.96 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2075  Cytochrome-c oxidase  31 
 
 
215 aa  80.1  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  26.6 
 
 
174 aa  79.3  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1958  cytochrome c oxidase subunit III  31.34 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.631978  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0050  cytochrome o ubiquinol oxidase subunit III  29.26 
 
 
209 aa  79  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0163303  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  33.51 
 
 
193 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2884  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  31.03 
 
 
203 aa  79  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  24 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0431  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit III  29.63 
 
 
215 aa  79  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3534  cytochrome c oxidase, subunit III  33.51 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0985  cytochrome c oxidase subunit III  28.19 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014250  Aazo_5355  cytochrome c oxidase  31.66 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3295  cytochrome c oxidase, subunit III  28.88 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.496142  normal  0.166605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>