More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6768 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  440  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  88.89 
 
 		 210 aa  373  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  69.23 
 
 		 220 aa  279  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  69.23 
 
 		 220 aa  278  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  70.56 
 
 		 220 aa  276  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  70.41 
 
 		 212 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  51.71 
 
 		 213 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  50.76 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 234 aa  174  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  39.8 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 226 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 200 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  38.86 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  40.29 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  36.5 
 
 		 234 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  36.08 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  34.2 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 212 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  41 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 208 aa  91.7  9e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 228 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  30.05 
 
 		 250 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 208 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 211 aa  89  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  32.32 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 209 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 226 aa  85.5  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  32.66 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33.14 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2292  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  34.53 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  37.58 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  27.72 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  33.78 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  30.26 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 208 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>