More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6743 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6743  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
413 aa  766  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.15445  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6493  major facilitator transporter  83.45 
 
 
417 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217095  normal  0.0270431 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2772  major facilitator transporter  44.87 
 
 
397 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0117  major facilitator transporter  40.46 
 
 
389 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0031  major facilitator transporter  43.36 
 
 
390 aa  209  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1373  major facilitator transporter  43.24 
 
 
390 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.421856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0041  major facilitator transporter  43.24 
 
 
390 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  37.22 
 
 
418 aa  182  8e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2751  major facilitator transporter  33.42 
 
 
407 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1836  major facilitator transporter  33.33 
 
 
412 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  28.29 
 
 
445 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 
395 aa  140  4e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 
411 aa  137  3e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1490  major facilitator transporter  32.14 
 
 
427 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189239  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
425 aa  134  2e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0035  major facilitator transporter  32.26 
 
 
405 aa  132  1e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.55843 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  33.33 
 
 
425 aa  131  2e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
415 aa  128  2e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 
392 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  31.85 
 
 
413 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5613  major facilitator protein family permease  31.02 
 
 
432 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  29.38 
 
 
418 aa  125  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  33.24 
 
 
418 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1289  major facilitator transporter  33.04 
 
 
405 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000170185  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0808  major facilitator transporter  33.04 
 
 
405 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000152405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  35.79 
 
 
414 aa  122  8e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0450  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
436 aa  122  1e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.912084  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1260  major facilitator transporter  33.04 
 
 
405 aa  122  1e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00393517  normal  0.0788656 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0872  major facilitator transporter  31.21 
 
 
414 aa  121  2e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104086  normal  0.268886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  29.27 
 
 
417 aa  122  2e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  27.91 
 
 
434 aa  122  2e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1147  major facilitator superfamily transporter  33.96 
 
 
420 aa  121  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  27.1 
 
 
434 aa  120  4e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  31.36 
 
 
427 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1068  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 
420 aa  119  8e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2869  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 
413 aa  118  2e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000467547  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0480  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
395 aa  118  2e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1897  major facilitator transporter  29.08 
 
 
416 aa  118  2e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0473254  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1279  major facilitator superfamily transporter  35.36 
 
 
493 aa  117  4e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4431  major facilitator transporter  32.14 
 
 
405 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  4.64132e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0294  major facilitator superfamily transporter  32.97 
 
 
412 aa  114  2e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111052 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0289  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
412 aa  115  2e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  31.28 
 
 
420 aa  114  4e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1178  major facilitator transporter  32.45 
 
 
410 aa  112  1e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0817029  normal  0.188851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1166  major facilitator transporter  32.65 
 
 
410 aa  111  2e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.117427  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0296  major facilitator transporter  30.62 
 
 
431 aa  111  2e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1500  major facilitator family transporter  32.27 
 
 
430 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154972  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  31.11 
 
 
420 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1604  major facilitator family tranporter  32.27 
 
 
412 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2031  major facilitator transporter  32.65 
 
 
410 aa  107  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000192505  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 
431 aa  107  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1470  major facilitator family transporter  32.27 
 
 
412 aa  107  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0767  major facilitator family tranporter  32.27 
 
 
430 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0560  major facilitator family transporter  32.27 
 
 
412 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0591  major facilitator family tranporter  32.27 
 
 
412 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1277  major facilitator family transporter  32.27 
 
 
412 aa  106  9e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.552414  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2160  major facilitator transporter  29.41 
 
 
433 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.652722 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2786  major facilitator family tranporter  31.67 
 
 
412 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  4.99606e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  29.74 
 
 
420 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4524  major facilitator superfamily transporter  29.6 
 
 
450 aa  99  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  29.15 
 
 
461 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  28.65 
 
 
432 aa  99  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0130  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 
407 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0236  major facilitator superfamily transporter  30.46 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.394936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  32.51 
 
 
407 aa  97.8  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1446  major facilitator transporter  28.24 
 
 
416 aa  95.5  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5634  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
371 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  26.84 
 
 
432 aa  94  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4899  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  30.57 
 
 
432 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  28.61 
 
 
428 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
441 aa  87.4  4e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  31.07 
 
 
434 aa  87  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  29.41 
 
 
417 aa  86.7  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  29.63 
 
 
430 aa  85.5  2e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  29.63 
 
 
430 aa  85.5  2e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  26.18 
 
 
430 aa  83.2  9e-15  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
446 aa  82.4  1e-14  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  30.04 
 
 
437 aa  81.6  2e-14  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 
446 aa  82  2e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.64401e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41790  carbohydrate transport membrane protein  25.47 
 
 
415 aa  81.6  2e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  25.91 
 
 
430 aa  82  2e-14  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
421 aa  81.3  3e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1756  major facilitator transporter  33.48 
 
 
407 aa  80.5  5e-14  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  31.45 
 
 
428 aa  79.3  1e-13  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  31.45 
 
 
428 aa  79.3  1e-13  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  26.45 
 
 
432 aa  78.2  2e-13  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  24.6 
 
 
425 aa  76.3  9e-13  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  31.52 
 
 
432 aa  76.3  9e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  24.6 
 
 
425 aa  76.3  1e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  26.38 
 
 
423 aa  75.1  2e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
439 aa  74.3  3e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.53779e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  28.65 
 
 
442 aa  73.9  5e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  25.96 
 
 
423 aa  73.6  6e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  26.19 
 
 
432 aa  72.4  1e-11  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  27.31 
 
 
426 aa  72.8  1e-11  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1641  transporter, MFS superfamily  27.15 
 
 
428 aa  72.8  1e-11  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00499002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  29.83 
 
 
398 aa  71.6  2e-11  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  27.43 
 
 
434 aa  71.2  3e-11  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0158  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
411 aa  71.2  3e-11  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>