More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6707 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6707  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 		 298 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572271  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6188  phosphoserine phosphatase SerB  84.23 
 
 		 298 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2777  phosphoserine phosphatase SerB  76.35 
 
 		 298 aa  435  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.64316  normal  0.211606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2882  phosphoserine phosphatase SerB  76.77 
 
 		 298 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2655  phosphoserine phosphatase SerB  76.43 
 
 		 298 aa  433  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.607459 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4531  phosphoserine phosphatase SerB  78.31 
 
 		 297 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.545382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3347  phosphoserine phosphatase SerB  62.96 
 
 		 297 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0178674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6089  phosphoserine phosphatase  61.54 
 
 		 296 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.562071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2345  phosphoserine phosphatase SerB  62.42 
 
 		 297 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.419363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2240  phosphoserine phosphatase SerB  62.42 
 
 		 297 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110047  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3257  phosphoserine phosphatase SerB  61.74 
 
 		 297 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.230695 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1660  phosphoserine phosphatase SerB  61.95 
 
 		 299 aa  323  3e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.922143  normal  0.466601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1744  phosphoserine phosphatase  58.45 
 
 		 295 aa  319  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121425  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  58.92 
 
 		 295 aa  308  9e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2096  phosphoserine phosphatase SerB  70 
 
 		 226 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.646648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1391  phosphoserine phosphatase  56.86 
 
 		 299 aa  302  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.115011  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1348  phosphoserine phosphatase SerB  56.86 
 
 		 299 aa  301  8.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.561677  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2809  phosphoserine phosphatase  54.55 
 
 		 296 aa  298  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.117358  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1800  phosphoserine phosphatase SerB  55.03 
 
 		 299 aa  295  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695243  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2462  phosphoserine phosphatase SerB  55.03 
 
 		 296 aa  294  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2797  phosphoserine phosphatase SerB  54.88 
 
 		 296 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.538623 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2538  phosphoserine phosphatase SerB  54.21 
 
 		 296 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.84987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2724  phosphoserine phosphatase SerB  65.55 
 
 		 241 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3139  phosphoserine phosphatase SerB  55.89 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.598874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1756  phosphoserine phosphatase SerB  54.7 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0018  phosphoserine phosphatase SerB  52.72 
 
 		 291 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.395606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1350  phosphoserine phosphatase  53.4 
 
 		 291 aa  278  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0008  phosphoserine phosphatase SerB  52.72 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197314 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3019  phosphoserine phosphatase  51.88 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.426286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3347  phosphoserine phosphatase SerB  55.81 
 
 		 289 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0812  phosphoserine phosphatase SerB  54.48 
 
 		 291 aa  266  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3316  phosphoserine phosphatase  53.06 
 
 		 292 aa  265  5.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.979977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0252  phosphoserine phosphatase  52.65 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2835  phosphoserine phosphatase SerB  52.03 
 
 		 332 aa  249  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.978803  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0465  phosphoserine phosphatase  53.38 
 
 		 299 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0607  phosphoserine phosphatase  54.39 
 
 		 292 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122548  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1777  phosphoserine phosphatase SerB  45.79 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3292  phosphoserine phosphatase SerB  45.7 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117576  normal  0.403499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  44.04 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1468  phosphoserine phosphatase SerB  46 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  43.45 
 
 		 398 aa  192  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2259  phosphoserine phosphatase  53.05 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.148184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  45.91 
 
 		 404 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  45.91 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  45.53 
 
 		 404 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  44.31 
 
 		 418 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  45.53 
 
 		 404 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  45.56 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  45.53 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  44.36 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  45.14 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  43.53 
 
 		 418 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  43.38 
 
 		 275 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  49.03 
 
 		 281 aa  181  9.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  45.38 
 
 		 404 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  49.37 
 
 		 420 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  45.74 
 
 		 411 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  46.29 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  46.06 
 
 		 406 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  44.76 
 
 		 419 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  45.29 
 
 		 410 aa  176  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  50.87 
 
 		 429 aa  175  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  48.44 
 
 		 438 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  45.65 
 
 		 403 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  42.11 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  50.25 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  49.25 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  43.17 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  42.8 
 
 		 404 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  42.75 
 
 		 404 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  39.84 
 
 		 278 aa  172  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  48.77 
 
 		 241 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  47.73 
 
 		 419 aa  172  6.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  49.25 
 
 		 279 aa  172  9e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  43.78 
 
 		 435 aa  171  1e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  44.76 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  51.28 
 
 		 237 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  47.6 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  49.27 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  49.27 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  46.67 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  49.75 
 
 		 281 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  47.62 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  43.33 
 
 		 264 aa  168  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  40.78 
 
 		 408 aa  168  9e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  47.26 
 
 		 280 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  48.08 
 
 		 237 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  45.79 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  44 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  44.8 
 
 		 285 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  48.76 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  44 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  48.1 
 
 		 237 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  36.46 
 
 		 410 aa  166  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  44.6 
 
 		 400 aa  166  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  44.05 
 
 		 404 aa  166  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  47.26 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  47.26 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  47.26 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  47.26 
 
 		 281 aa  165  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>