More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6676 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6676  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  343  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6990  NusG antitermination factor  34.57 
 
 		 254 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6556  NusG antitermination factor  33.93 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0171458  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  31.28 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4274  NusG antitermination factor  32.34 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6268  NusG antitermination factor  28.65 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  30.73 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5072  NusG antitermination factor  32.34 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  24.86 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  30.17 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194  transcriptional activator rfaH, putative  23.23 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  30.17 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3558  NusG antitermination factor  30.64 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1375  NusG antitermination factor  26.14 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  23.6 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0444  transcription antitermination protein NusG  25.28 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00370515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1374  transcription antitermination protein nusG  21.15 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000814975  hitchhiker  0.00000420235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2544  NusG antitermination factor  21.66 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5952  NusG antitermination factor  32.39 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1314  transcription antitermination protein nusG  21.29 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0397005  normal  0.368263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1381  transcription antitermination protein nusG  21.29 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111282  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  42.86 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  27.12 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  27.12 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0093  transcription antitermination protein nusG  27.59 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  27.37 
 
 		 176 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  25.71 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  27.37 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0503  transcription antitermination protein NusG  26.4 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000847234  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0523  transcription antitermination protein NusG  26.4 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0829173  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  26.82 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  27.59 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1461  transcription antitermination protein NusG  26.4 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  28.89 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  28.96 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1622  transcription antiterminator  38.89 
 
 		 297 aa  52.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000761547  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  27.37 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0560  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  26.55 
 
 		 179 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  26.97 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  43.75 
 
 		 280 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  28.09 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  51.61 
 
 		 176 aa  52  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  28.09 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  27.37 
 
 		 176 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3036  transcriptional acivator RfaH  21.94 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00758207  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2894  transcriptional acivator RfaH  21.94 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000245267  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1469  transcriptional acivator RfaH  21.52 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000410204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2904  transcriptional acivator RfaH  21.52 
 
 		 168 aa  51.6  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160957  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0382  transcription antitermination protein NusG  36.84 
 
 		 182 aa  51.6  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  52.94 
 
 		 250 aa  51.6  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  57.14 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  25.99 
 
 		 177 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  25.99 
 
 		 177 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  25.99 
 
 		 177 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2844  NusG antitermination factor  25.32 
 
 		 170 aa  51.2  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117724  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1321  transcription antitermination protein NusG  25.84 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  32.41 
 
 		 242 aa  51.2  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  30 
 
 		 175 aa  51.2  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  32.41 
 
 		 242 aa  50.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  28.75 
 
 		 175 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1549  transcription antitermination protein nusG  26.18 
 
 		 234 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.671844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  26.82 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  52.83 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  26.82 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  23.33 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  52.83 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  27.59 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1217  transcription termination/antitermination factor NusG  37.8 
 
 		 298 aa  49.7  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  50.91 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  27.59 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  26.7 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  31.07 
 
 		 190 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0396  transcription termination/antitermination factor NusG  22.63 
 
 		 184 aa  49.3  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000310476  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  29.55 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0357  transcription antitermination protein NusG  35.79 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  29.55 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  29.55 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  29.55 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  25.57 
 
 		 176 aa  48.5  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  25.99 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  54.17 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2259  NusG antitermination factor  37.84 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  36.46 
 
 		 228 aa  48.5  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  31.65 
 
 		 185 aa  48.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3454  NusG antitermination factor  30.91 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000805693  normal  0.0356218 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0497  transcription termination/antitermination factor NusG  28.41 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  41.27 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0253  NusG antitermination factor  43.33 
 
 		 245 aa  48.1  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000000116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  37.35 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1492  NusG antitermination factor  22.53 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.509367  normal  0.372591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  29.55 
 
 		 181 aa  48.1  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  25.42 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1668  transcription antitermination protein NusG  25.14 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0130356  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  25.42 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  54.17 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  54.9 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  23.33 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  49.02 
 
 		 180 aa  47.8  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  29.14 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>