More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6398 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 215 aa  424  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  77.73 
 
 		 217 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  75.12 
 
 		 217 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  65.48 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 290 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  52.45 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  47 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  46.31 
 
 		 216 aa  162  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1244  GntR family transcriptional regulator  49.27 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1871  GntR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.909537  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0521  GntR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.803557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 214 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2296  GntR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4210  GntR family transcriptional regulator  46 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.804169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3944  GntR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 211 aa  138  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2389  putative transcriptional regulator  48.99 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1061  GntR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 242 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  41.29 
 
 		 227 aa  127  9.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  38.22 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2514  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 234 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 229 aa  114  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  40.7 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 241 aa  112  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 230 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  41.29 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  38.86 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  40.88 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 228 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 228 aa  108  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  40.1 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 227 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0794  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 232 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 240 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 255 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0841  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 231 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 262 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 262 aa  102  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2323  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.474326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  40.51 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  38.31 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 		 212 aa  102  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 235 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1121  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 234 aa  101  9e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  34.31 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  34.62 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 244 aa  98.2  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  97.1  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  39.13 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>