More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6380 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6380  Rhodanese domain protein  100 
 
 
280 aa  557  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5874  rhodanese domain-containing protein  88.21 
 
 
280 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2500  Rhodanese domain protein  72.14 
 
 
282 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.585045  normal  0.552129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2791  Rhodanese domain protein  69.64 
 
 
282 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.798975  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2568  rhodanese domain-containing protein  69.29 
 
 
282 aa  403  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.50552  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3798  rhodanese domain-containing protein  71.07 
 
 
281 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.271835  normal  0.0625377 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2634  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.8 
 
 
283 aa  301  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1365  rhodanese domain-containing protein  54.91 
 
 
287 aa  296  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.247662  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0122  rhodanese domain-containing protein  57.61 
 
 
282 aa  296  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0146  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  58.7 
 
 
291 aa  295  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.717164  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0430  Rhodanese domain protein  54.18 
 
 
286 aa  293  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2989  rhodanese domain-containing protein  55.23 
 
 
281 aa  292  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.700254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0885  thiosulfate sulfurtransferase, rhodanese-like  56.88 
 
 
282 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2544  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  56.88 
 
 
282 aa  293  3e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2142  rhodanese domain-containing protein  53.45 
 
 
284 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.557885  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0030  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.8 
 
 
287 aa  288  6e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.918889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2925  rhodanese domain-containing protein  53.41 
 
 
283 aa  288  9e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4678  rhodanese domain-containing protein  53.93 
 
 
284 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1436  Rhodanese domain protein  52.73 
 
 
289 aa  281  9e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.506053  normal  0.624415 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1615  Rhodanese domain protein  51.82 
 
 
289 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  normal  0.481952 
 
 
-
 
NC_004310  BR1055  rhodanese family protein  50.91 
 
 
284 aa  279  4e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1020  rhodanese family protein  51.09 
 
 
284 aa  278  6e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.85738  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1219  rhodanese domain-containing protein  50.18 
 
 
284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.315032  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0631  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.99 
 
 
286 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1877  thiosulfate sulfurtransferase  51.09 
 
 
477 aa  272  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.346194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1615  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50 
 
 
285 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1426  rhodanese-like protein  52.71 
 
 
281 aa  261  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.334626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.63 
 
 
284 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02413  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.2 
 
 
281 aa  250  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1147  Rhodanese domain protein  48.2 
 
 
281 aa  250  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2805  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.2 
 
 
281 aa  250  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3750  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.2 
 
 
281 aa  250  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1156  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.2 
 
 
281 aa  250  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.831294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2673  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.84 
 
 
281 aa  250  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121629  normal  0.540659 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02375  hypothetical protein  48.2 
 
 
281 aa  250  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3017  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.2 
 
 
281 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.439328  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3775  rhodanese domain-containing protein  50.36 
 
 
288 aa  249  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2672  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.84 
 
 
281 aa  248  6e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2896  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.84 
 
 
281 aa  248  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2791  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.84 
 
 
280 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2728  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.84 
 
 
280 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2685  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.84 
 
 
280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.362659  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2772  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.84 
 
 
280 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573482  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2904  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.84 
 
 
280 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.823076  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3021  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.38 
 
 
289 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.927756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4133  Rhodanese domain protein  47.86 
 
 
286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3061  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.55 
 
 
279 aa  242  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.122579  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0405  rhodanese-like protein  48.38 
 
 
284 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484971  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2866  rhodanese domain-containing protein  42.29 
 
 
284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1333  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.29 
 
 
284 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1432  rhodanese domain-containing protein  45.02 
 
 
281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.90665  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0854  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.84 
 
 
289 aa  239  5e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1555  mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.56 
 
 
316 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2787  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.94 
 
 
284 aa  238  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3457  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.04 
 
 
285 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.167949  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2553  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.74 
 
 
289 aa  236  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0650161  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1253  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.93 
 
 
289 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1113  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.6 
 
 
284 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2127  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.21 
 
 
285 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.312853  hitchhiker  0.0057571 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2263  rhodanese domain-containing protein  47.67 
 
 
284 aa  231  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.552964  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6256  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.4 
 
 
285 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.380191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0100  rhodanese domain-containing protein  44.2 
 
 
286 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.602678  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1915  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.68 
 
 
285 aa  225  8e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.021654  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2490  rhodanese-related sulfurtransferase  46.4 
 
 
292 aa  220  3e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.36636  normal  0.490803 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1494  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.21 
 
 
276 aa  219  3e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5914  thiosulfate sulfurtransferase  42.55 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259229  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2916  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.55 
 
 
286 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3630  rhodanese-like protein  41.79 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.69295  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2642  rhodanese-like protein  43.64 
 
 
286 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0193  Rhodanese domain protein  44.4 
 
 
284 aa  207  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0926264  normal  0.228732 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0562  putative thiosulfate sulfurtransferase SseA  38.49 
 
 
276 aa  202  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1421  sulfurtransferase (rhodanese-like protein)  36.96 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_13229  predicted protein  40.28 
 
 
304 aa  195  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000488  rhodanese-related sulfurtransferase  37.69 
 
 
276 aa  186  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.572454  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02073  rhodanese-related sulfurtransferase  42.02 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.161687  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3006  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  38.25 
 
 
285 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148603  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06252  thiosulfate sulfurtransferase SseA  34.3 
 
 
276 aa  182  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3103  rhodanese domain-containing protein  37.89 
 
 
285 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2221  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  36.2 
 
 
283 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.28427  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2924  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.89 
 
 
285 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.860252  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3019  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.59 
 
 
277 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1261  mercaptopyruvate sulfurtransferase  37.81 
 
 
285 aa  176  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3747  rhodanese-like protein  40.65 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.745396  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10395  thiosulfate sulfurtransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01370)  36.9 
 
 
344 aa  172  7.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0802234  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0968  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.54 
 
 
284 aa  171  9e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  41.05 
 
 
288 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  40.14 
 
 
285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1160  rhodanese domain-containing protein  35.74 
 
 
285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1192  rhodanese domain-containing protein  35.74 
 
 
285 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0358282  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1088  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.4 
 
 
285 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01483  hypothetical protein  34.39 
 
 
255 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3198  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
285 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.387721 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17215  predicted protein  36.13 
 
 
297 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  36.93 
 
 
291 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  36.52 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1047  Rhodanese domain protein  34.86 
 
 
289 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03690  thiosulfate sulfurtransferase, putative  36.64 
 
 
340 aa  144  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.376114  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  40.21 
 
 
283 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1618  Rhodanese domain protein  34.6 
 
 
291 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.97892  normal  0.0367317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  40.29 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>