More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6327 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 872 aa  1796    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  34.53 
 
 		 857 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  27.42 
 
 		 1067 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1479  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 2046 aa  276  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.604446 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 1152 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 1152 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  26.3 
 
 		 746 aa  250  8e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 		 734 aa  212  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 		 880 aa  203  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4777  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 		 742 aa  191  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 		 832 aa  189  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4260  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 		 742 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109167  normal  0.249298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2009  glycosyl transferase  30.28 
 
 		 810 aa  182  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0236  hypothetical protein  26.55 
 
 		 783 aa  181  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000717832  normal  0.75423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4626  glycosyl transferase family 2  26.24 
 
 		 742 aa  180  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.18553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3926  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 1509 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.554209  normal  0.869546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 		 988 aa  177  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 958 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  40.38 
 
 		 849 aa  174  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 		 632 aa  170  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15980  Glycosyl transferase, family 2  33.7 
 
 		 1182 aa  168  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 		 996 aa  168  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0396  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 625 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0878  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 625 aa  160  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1503  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 		 733 aa  160  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1074  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.04 
 
 		 1561 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.755532  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0288  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 		 709 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0772  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 		 709 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  22.13 
 
 		 1334 aa  158  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3973  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 		 1275 aa  157  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00968  putative glycosyltransferase family 2 protein  26.28 
 
 		 731 aa  155  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0852  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 765 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 1486 aa  150  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  25.47 
 
 		 1991 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2052  glycosyl transferase family 2  27.77 
 
 		 794 aa  150  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.039975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3348  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 1074 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861977  normal  0.0615574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1948  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 		 721 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 		 625 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1815  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 958 aa  148  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.613695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0883  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 		 723 aa  148  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 		 983 aa  148  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0354  glycosyl transferase family protein  25.84 
 
 		 658 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.96 
 
 		 1366 aa  132  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 		 1084 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 1009 aa  124  6e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1840  glycosyl transferase family 2  23.98 
 
 		 710 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0202284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2225  glycosyl transferase family 2  24.39 
 
 		 717 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.432582 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  31.82 
 
 		 2342 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  31.82 
 
 		 2342 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0315  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 775 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.177291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4005  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 790 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 		 756 aa  115  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  30.86 
 
 		 2796 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1729  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 		 728 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.95068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  48.31 
 
 		 1806 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  48.31 
 
 		 1632 aa  112  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1949  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 717 aa  107  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0804  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 		 725 aa  106  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0845  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 		 725 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00935412  normal  0.295818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  34.39 
 
 		 916 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  40.17 
 
 		 535 aa  101  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 322 aa  99.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  23.04 
 
 		 1644 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  23.04 
 
 		 1644 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  31.27 
 
 		 261 aa  98.6  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01471  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1049 aa  96.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 		 1247 aa  95.1  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  31.58 
 
 		 521 aa  94.4  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  29.07 
 
 		 255 aa  93.6  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 1044 aa  92.4  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 1250 aa  91.7  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 321 aa  91.3  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  48.57 
 
 		 361 aa  91.3  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 397 aa  91.3  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  48.57 
 
 		 361 aa  90.9  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 665 aa  90.9  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 		 1301 aa  90.9  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  29.71 
 
 		 334 aa  90.9  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  29.54 
 
 		 305 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.68 
 
 		 341 aa  89.7  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 		 323 aa  89.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 1322 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 373 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  27.4 
 
 		 303 aa  89  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 1313 aa  89  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  47.62 
 
 		 361 aa  89  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  25.1 
 
 		 398 aa  88.6  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0769  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 		 732 aa  88.6  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034944 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 		 297 aa  88.2  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0117  glycosyl transferase family 2  27.46 
 
 		 777 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.389637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  26.71 
 
 		 330 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  38.95 
 
 		 678 aa  84.7  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  57.75 
 
 		 115 aa  84.7  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 		 344 aa  84  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 349 aa  83.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  57.75 
 
 		 120 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.1 
 
 		 326 aa  84  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 316 aa  84  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 280 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>