62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6222 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  82.55 
 
 		 3006 aa  3595    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  65.96 
 
 		 3238 aa  2459    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  73.58 
 
 		 2900 aa  3209    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  71.94 
 
 		 2899 aa  3109    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  74.48 
 
 		 3286 aa  2095    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 2140 aa  4331    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  38.6 
 
 		 1100 aa  503  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  55 
 
 		 3521 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  37.95 
 
 		 1051 aa  489  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  39.77 
 
 		 1133 aa  487  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  39.52 
 
 		 1101 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1092 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  36.55 
 
 		 1219 aa  444  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  36.81 
 
 		 1221 aa  445  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  35.54 
 
 		 1543 aa  440  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  36.2 
 
 		 1341 aa  437  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  37.02 
 
 		 1103 aa  433  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  35.61 
 
 		 1816 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  34.58 
 
 		 1061 aa  425  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  35.11 
 
 		 1188 aa  416  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  32.92 
 
 		 1067 aa  414  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  35.37 
 
 		 1116 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  35.35 
 
 		 1116 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  32.69 
 
 		 1057 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  34.91 
 
 		 1120 aa  383  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  35.2 
 
 		 1132 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  35.33 
 
 		 1137 aa  384  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  34.27 
 
 		 1194 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  33.86 
 
 		 2007 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1132 aa  380  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  35.01 
 
 		 1159 aa  380  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  35.06 
 
 		 1132 aa  380  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  34.84 
 
 		 1159 aa  379  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  35.09 
 
 		 1120 aa  380  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  34.92 
 
 		 1158 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  34.92 
 
 		 1158 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  34.97 
 
 		 1157 aa  370  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  34.56 
 
 		 1157 aa  361  7e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1159 aa  361  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1159 aa  359  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  34.2 
 
 		 1157 aa  358  6.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  32.38 
 
 		 1059 aa  356  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  38.28 
 
 		 522 aa  332  6e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  36.46 
 
 		 1012 aa  317  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  34.09 
 
 		 881 aa  216  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  36.25 
 
 		 951 aa  192  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3247  hypothetical protein  42.66 
 
 		 287 aa  174  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  31.65 
 
 		 837 aa  152  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  26.42 
 
 		 960 aa  141  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3248  hypothetical protein  35.95 
 
 		 425 aa  129  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  28.68 
 
 		 1564 aa  108  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  23.65 
 
 		 918 aa  82.4  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6221  hypothetical protein  29.73 
 
 		 729 aa  81.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  22.53 
 
 		 1644 aa  67.4  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  30.28 
 
 		 1171 aa  63.2  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  23.21 
 
 		 2196 aa  57.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1315  hypothetical protein  29.59 
 
 		 702 aa  57.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3499  hypothetical protein  29.92 
 
 		 833 aa  51.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1315  Hedgehog/intein hint domain protein  28.81 
 
 		 1115 aa  48.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1446  fibronectin, type III domain-containing protein  26.83 
 
 		 1089 aa  47.4  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3558  hypothetical protein  25 
 
 		 1172 aa  46.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1764  hypothetical protein  28.67 
 
 		 771 aa  45.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0992615  normal  0.125596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>