More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6174 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 
246 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2338  CBS domain containing membrane protein  82.85 
 
 
247 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3570  CBS domain-containing protein  71.19 
 
 
246 aa  316  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.212334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4051  signal-transduction protein  41.56 
 
 
242 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5760  hypothetical protein  40.74 
 
 
242 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.594459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1344  putative signal-transduction protein with CBS domains  42.68 
 
 
243 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1912  signal-transduction protein  42.19 
 
 
242 aa  176  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0206039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1023  hypothetical protein  44.12 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4725  putative signal transduction protein with CBS domains  40.59 
 
 
243 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1365  signal-transduction protein  41.84 
 
 
243 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.831809  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3596  CBS domain-containing protein  44.74 
 
 
241 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.247468  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1947  signal-transduction protein  44.1 
 
 
226 aa  162  7e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.489577  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  42.4 
 
 
230 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1902  CBS domain-containing protein  40.99 
 
 
231 aa  155  8e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1094  signal-transduction protein  39.11 
 
 
230 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2202  putative signal transduction protein with CBS domains  39.74 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2522  CBS domain containing membrane protein  45.65 
 
 
235 aa  148  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0807239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  38.43 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1933  CBS domain-containing protein  38.29 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.316651  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1028  CBS domain containing membrane protein  36.04 
 
 
226 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0495705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5546  CBS domain containing membrane protein  40.09 
 
 
230 aa  141  9e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103522  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1630  signal-transduction protein  36.32 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  41.67 
 
 
242 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5821  signal-transduction protein  39.11 
 
 
231 aa  138  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.12685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1873  hypothetical protein  38.46 
 
 
229 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2233  CBS domain-containing protein  40.09 
 
 
232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6307  putative signal transduction protein with CBS domains  37.39 
 
 
229 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1897  signal-transduction protein  33.48 
 
 
231 aa  125  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2997  signal-transduction protein  35.78 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6177  transport-associated  41.3 
 
 
198 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.896076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1228  signal-transduction protein  38.51 
 
 
339 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3889  signal-transduction protein  35.38 
 
 
217 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1883  CBS domain-containing protein  38.93 
 
 
154 aa  105  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  40.27 
 
 
153 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0305  CBS domain containing membrane protein  37.58 
 
 
147 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 
149 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  39.58 
 
 
152 aa  101  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  34.2 
 
 
227 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3021  CBS domain containing membrane protein  35.62 
 
 
149 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  37.67 
 
 
153 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1262  CBS domain containing membrane protein  34.93 
 
 
149 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00178252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  38.46 
 
 
155 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  38.19 
 
 
152 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1882  CBS domain-containing protein  32.88 
 
 
149 aa  97.4  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000211918  hitchhiker  0.00000438045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4019  hypothetical protein  36.49 
 
 
339 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.191976  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  38 
 
 
132 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2529  CBS domain containing membrane protein  39.44 
 
 
149 aa  95.9  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00130386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  36.24 
 
 
152 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1801  CBS domain-containing protein  34.27 
 
 
149 aa  92.8  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0256126  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1413  putative signal-transduction protein with CBS domains  38.36 
 
 
338 aa  92.8  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1649  CBS domain-containing membrane protein  32.49 
 
 
234 aa  92  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0176167  normal  0.734042 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2805  CBS domain-containing membrane protein  35.17 
 
 
155 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17480  predicted signal-transduction protein containing cAMP-binding and CBS domains  33.94 
 
 
191 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  36.81 
 
 
153 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3002  signal-transduction protein  38.37 
 
 
333 aa  89.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2320  CBS domain-containing protein  32.88 
 
 
150 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000465345  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2812  CBS domain containing membrane protein  34.07 
 
 
201 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000718769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3960  CBS domain containing protein  34.23 
 
 
153 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4005  CBS domain containing protein  34.23 
 
 
153 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1032  putative signal transduction protein with CBS domains  32.67 
 
 
149 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1851  CBS domain containing membrane protein  34.01 
 
 
151 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.309684  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  29.53 
 
 
152 aa  85.5  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2980  signal transduction protein  35.44 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0803  signal transduction protein  43.18 
 
 
160 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.708068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2260  CBS domain-containing protein  35.21 
 
 
150 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000586041  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1824  CBS  34.25 
 
 
154 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.539518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0591  signal-transduction protein  33.33 
 
 
155 aa  84  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0331315  normal  0.426072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2844  CBS domain-containing protein  38.96 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0646  CBS  34.48 
 
 
332 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  32.24 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  32.51 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 
427 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3311  CBS domain-containing protein  34.72 
 
 
141 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.881932 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2021  CBS domain containing membrane protein  35 
 
 
164 aa  82  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0610  signal-transduction protein  32.32 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909822  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  32.21 
 
 
150 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3833  putative signal transduction protein with CBS domains  32.57 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0502745  normal  0.174348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2046  CBS  32.88 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4751  CBS domain containing membrane protein  36.05 
 
 
154 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142923  hitchhiker  0.00000010565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3042  CBS  33.19 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  34.64 
 
 
158 aa  79  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  30.63 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  38.46 
 
 
196 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1134  signal transduction protein  36.05 
 
 
151 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  33.79 
 
 
120 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0019  CBS domain-containing protein  36.62 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  30.53 
 
 
155 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_8994  predicted protein  35.97 
 
 
133 aa  77.4  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2521  signal transduction protein  31.33 
 
 
161 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0119  CBS domain containing protein  33.77 
 
 
181 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.851715  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4839  CBS domain containing membrane protein  32.9 
 
 
232 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2232  CBS domain containing membrane protein  33.33 
 
 
164 aa  77  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  36.31 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2711  CBS domain-containing membrane protein  32.14 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2008  CBS  33.56 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0317  CBS domain-containing protein  37.32 
 
 
374 aa  75.9  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.250348  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2661  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.611003  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0675  signal transduction protein  30.26 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1614  CBS domain-containing protein  40.13 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 
154 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>