More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6130 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6130  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8765  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  96.72 
 
 		 244 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.474033  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2990  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.67 
 
 		 244 aa  191  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2763  cyclic nucleotide-binding  42.67 
 
 		 244 aa  192  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2024  cyclic nucleotide-binding  45.22 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.996332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2301  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  45.22 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2886  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.98 
 
 		 244 aa  188  7e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1986  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.48 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3758  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.85 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3385  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  43.04 
 
 		 384 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0060  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  42.61 
 
 		 384 aa  179  4e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6209  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 247 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0102902  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1441  Crp/FNR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 259 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0073  cyclic nucleotide-binding  42.11 
 
 		 255 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0783  cyclic nucleotide-binding  41.74 
 
 		 376 aa  175  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0359827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5597  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.28 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0675352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0133  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.56 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564261  normal  0.0379159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3499  CRP/FNR family transcriptional regulator  40 
 
 		 286 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4270  CRP/FNR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 225 aa  168  8e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7493  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.39 
 
 		 246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6403  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5361  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.8 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4876  cyclic nucleotide-binding  40.8 
 
 		 317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.23 
 
 		 249 aa  161  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.582037  normal  0.123136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7477  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.1 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.403111  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5417  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  39.3 
 
 		 298 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37 
 
 		 307 aa  156  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3389  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.45 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2433  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 247 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168738  normal  0.817452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1230  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.583862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3788  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  41.87 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.371562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3480  cyclic nucleotide-binding  41.87 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1835  cyclic nucleotide-binding protein  38.53 
 
 		 281 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.342582  normal  0.0135439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4036  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 315 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6249  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4497  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.37 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140276  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4564  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00106309 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2367  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.95 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0615204  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.73 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0738845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1439  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 243 aa  145  6e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1991  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.09 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2686  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.91 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.038663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3832  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.72 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4786  cyclic nucleotide-binding protein  34.91 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0772  cyclic nucleotide-binding  33.33 
 
 		 254 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2950  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1485  cyclic nucleotide-binding protein  35.03 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1427  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.25 
 
 		 267 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0953  CRP/FNR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  38.04 
 
 		 242 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0859  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 234 aa  118  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0477074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0955  CRP/FNR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.869769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2447  cyclic nucleotide-binding protein  33.77 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2609  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 293 aa  111  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1953  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0604  cyclic nucleotide-binding protein  30.7 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3486  putative signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173486 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2391  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3616  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3367  CRP/FNR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.184948  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2108  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.819689  normal  0.0771917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1184  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.63 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0266  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6056  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0189  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.338052  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0196  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0367027  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4068  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0414  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 252 aa  88.6  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.766284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0357  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 252 aa  88.6  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3805  cyclic nucleotide-binding  29.67 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0532  cyclic nucleotide-binding protein  27.13 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1862  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.79 
 
 		 250 aa  86.3  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0720375  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1854  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.41 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.191124  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2575  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0983  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2201  transcriptional regulator  25.23 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.586423 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0447  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00494896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0490  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1734  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.79675  hitchhiker  0.000773544 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3844  cyclic nucleotide-binding protein  27.87 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1787  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.89 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4040  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858211 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5989  transcriptional regulator CRP family  27.66 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0997  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.8 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4822  cyclic nucleotide-binding protein  27.23 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  normal  0.123433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1000  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.523077  normal  0.289991 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2400  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0375093 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1275  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2934  cyclic nucleotide-binding protein  25.93 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.46 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1153  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3865  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2705  cyclic nucleotide-binding protein  27.72 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.03 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.948966  hitchhiker  0.00636029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0660  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1993  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  22.64 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.238952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1987  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  24.64 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5658  cyclic nucleotide-binding protein  26.38 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1742  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.275504  normal  0.265558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>