242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6108 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  516  1e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  99.58 
 
 
346 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  90.4 
 
 
250 aa  471  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  90 
 
 
250 aa  470  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  89.2 
 
 
250 aa  466  1e-130  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  89.2 
 
 
250 aa  464  1e-130  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  89.2 
 
 
250 aa  460  1e-128  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  90 
 
 
250 aa  459  1e-128  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  87.6 
 
 
246 aa  450  1e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  79.6 
 
 
250 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  79.6 
 
 
250 aa  429  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  84 
 
 
250 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  82 
 
 
250 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  76.71 
 
 
259 aa  399  1e-110  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  71.2 
 
 
346 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  92.5 
 
 
319 aa  384  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  77.2 
 
 
234 aa  374  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  86.93 
 
 
227 aa  358  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  75.24 
 
 
224 aa  339  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  64.92 
 
 
224 aa  332  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  45.92 
 
 
255 aa  197  1e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  46.15 
 
 
254 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  46.15 
 
 
254 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  48.31 
 
 
218 aa  189  3e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  46.15 
 
 
264 aa  189  3e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  47.62 
 
 
238 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  48.31 
 
 
302 aa  185  5e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  48.31 
 
 
235 aa  184  8e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  46.86 
 
 
235 aa  181  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  38.77 
 
 
235 aa  172  4e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  44.23 
 
 
235 aa  172  5e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  38.33 
 
 
235 aa  171  9e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  38.33 
 
 
235 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  39.65 
 
 
235 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  45.19 
 
 
234 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  45.19 
 
 
234 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  45.19 
 
 
240 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  45.19 
 
 
234 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  45.19 
 
 
234 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  45.19 
 
 
240 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  45.19 
 
 
240 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  45.19 
 
 
234 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  45.19 
 
 
240 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  45.19 
 
 
240 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  45.19 
 
 
240 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  45.19 
 
 
240 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  45.19 
 
 
240 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  45.19 
 
 
240 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  45.19 
 
 
240 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  45.19 
 
 
240 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  45.19 
 
 
240 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  45.19 
 
 
240 aa  169  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  45.19 
 
 
234 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  45.19 
 
 
234 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  45.19 
 
 
234 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  45.19 
 
 
234 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  45.19 
 
 
234 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  45.19 
 
 
234 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  45.19 
 
 
234 aa  169  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0613  hypothetical protein  43.96 
 
 
235 aa  168  8e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  41.79 
 
 
243 aa  165  6e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  38.16 
 
 
222 aa  162  4e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  40.28 
 
 
228 aa  162  5e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  40.48 
 
 
228 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  40.48 
 
 
228 aa  160  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  43.37 
 
 
236 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  39.34 
 
 
228 aa  159  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  38.28 
 
 
227 aa  152  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1573  integrase catalytic subunit  39.9 
 
 
238 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4558  transposase  42.42 
 
 
215 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  35.56 
 
 
246 aa  148  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5316  putative transposase  39 
 
 
238 aa  146  2e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.110723  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5309  putative transposase  40 
 
 
212 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.67 
 
 
230 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.67 
 
 
230 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.09545e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  36.67 
 
 
230 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  6.73893e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  36.67 
 
 
230 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.04677e-06  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  41.62 
 
 
206 aa  145  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  41.9 
 
 
185 aa  145  8e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  41.9 
 
 
185 aa  144  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3358  integrase catalytic region  38.66 
 
 
198 aa  143  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1660  transposase  39.61 
 
 
263 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  47.89 
 
 
181 aa  141  1e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1668  transposase  39.41 
 
 
341 aa  141  1e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.892331  normal 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  38.25 
 
 
226 aa  139  5e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  38.25 
 
 
226 aa  139  5e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3336  IS240 transposase  37.88 
 
 
202 aa  139  5e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.1619  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  38.25 
 
 
226 aa  139  5e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  37.22 
 
 
224 aa  136  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  37.22 
 
 
224 aa  136  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  37.22 
 
 
224 aa  136  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  37.22 
 
 
224 aa  136  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  37.79 
 
 
226 aa  135  6e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  39.71 
 
 
224 aa  135  6e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  39.71 
 
 
224 aa  135  6e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  38.73 
 
 
214 aa  134  1e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  39 
 
 
226 aa  134  1e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  38.5 
 
 
226 aa  134  1e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  38.5 
 
 
226 aa  133  2e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  40.49 
 
 
221 aa  133  2e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>