More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6056 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6056  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00777479  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5851  GntR family transcriptional regulator  83.67 
 
 		 264 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.571197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2299  GntR family transcriptional regulator  47.43 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.171843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.596979 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  29.71 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.62 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 249 aa  105  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3150  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000981065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 260 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  29.18 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  31.12 
 
 		 241 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 244 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 244 aa  98.6  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 244 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 244 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  33.89 
 
 		 244 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 244 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 244 aa  99  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 248 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 239 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 244 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  30.93 
 
 		 250 aa  96.7  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 286 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  26.75 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0478  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 244 aa  95.1  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0696996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 240 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  32.79 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15390  transcriptional regulator  37.77 
 
 		 277 aa  92.4  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.457467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 		 248 aa  92.4  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1988  GntR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 249 aa  92.4  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 248 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  26.84 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.91 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 244 aa  90.1  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 265 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 265 aa  88.6  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 241 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4635  transcriptional regulator, GntR family  27.62 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000503298  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 256 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 256 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 256 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  26.5 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  31.85 
 
 		 246 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>