75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6023 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
184 aa  377  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  37.18 
 
 
208 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  38.26 
 
 
209 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  29.05 
 
 
198 aa  76.3  3e-13  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
185 aa  74.3  8e-13  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
182 aa  73.9  1e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  30.05 
 
 
182 aa  72.8  3e-12  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
192 aa  72  4e-12  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  6.20531e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
177 aa  71.2  8e-12  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
206 aa  69.3  3e-11  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 
199 aa  69.3  3e-11  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 
188 aa  68.9  4e-11  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  31.52 
 
 
202 aa  68.2  7e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  29.03 
 
 
191 aa  65.5  5e-10  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
211 aa  64.7  8e-10  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
211 aa  64.7  8e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
211 aa  64.7  8e-10  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
238 aa  64.3  1e-09  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  31.03 
 
 
238 aa  63.9  1e-09  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
238 aa  64.3  1e-09  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  31.03 
 
 
238 aa  64.3  1e-09  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
238 aa  64.3  1e-09  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  31.25 
 
 
215 aa  63.9  1e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  30.23 
 
 
205 aa  63.9  1e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.84066e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  31.03 
 
 
238 aa  64.3  1e-09  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
180 aa  63.2  2e-09  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 
187 aa  62.8  3e-09  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 
184 aa  62.8  3e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
180 aa  61.6  5e-09  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
188 aa  61.6  5e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
211 aa  61.6  6e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
187 aa  61.2  7e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
207 aa  60.5  1e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 
199 aa  59.7  2e-08  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
215 aa  59.3  3e-08  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
188 aa  58.5  5e-08  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
192 aa  58.5  5e-08  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
202 aa  58.2  7e-08  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 
187 aa  55.1  5e-07  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
209 aa  53.9  1e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
214 aa  54.3  1e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
186 aa  53.1  2e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 
217 aa  52.8  3e-06  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 
217 aa  52.8  3e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
187 aa  52.4  3e-06  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 
224 aa  52.8  3e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 
209 aa  52.4  4e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
205 aa  52.4  4e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 
197 aa  52  5e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
205 aa  52  5e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
205 aa  52  5e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
211 aa  50.4  2e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 
231 aa  49.7  3e-05  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 
209 aa  49.3  3e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
186 aa  48.9  4e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
213 aa  48.9  4e-05  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 
186 aa  48.5  5e-05  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
194 aa  48.1  7e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
188 aa  47.8  8e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  28.29 
 
 
207 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 
201 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
212 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
188 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  45.45 
 
 
197 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 
194 aa  42  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
210 aa  41.6  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 
177 aa  41.6  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 
194 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 
194 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 
194 aa  41.6  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 
194 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
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