269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5976 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 315 aa  614  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  89.61 
 
 		 321 aa  479  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  65.37 
 
 		 315 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  52.08 
 
 		 308 aa  292  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  50.48 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  47.57 
 
 		 349 aa  258  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  45.05 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  45.51 
 
 		 352 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  47.77 
 
 		 310 aa  245  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  45.45 
 
 		 315 aa  241  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  46.74 
 
 		 310 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  46.74 
 
 		 310 aa  233  3e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  44.75 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  44.33 
 
 		 320 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  42.95 
 
 		 364 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  42.62 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  42.27 
 
 		 347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  43.99 
 
 		 351 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  38.91 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  32.27 
 
 		 319 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  37.39 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  38.14 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  32.14 
 
 		 323 aa  122  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  33.1 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  34.13 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  28.76 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  35.06 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  33.09 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  37.15 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  33.11 
 
 		 287 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  21.88 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  34.4 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3115  hypothetical protein  32.69 
 
 		 351 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  31.6 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  29.8 
 
 		 337 aa  102  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  34.6 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  28.73 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  30.86 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  34.55 
 
 		 319 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  34.55 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  35.02 
 
 		 312 aa  99  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  33.21 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  33.21 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  29.59 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3186  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 		 271 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.71 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4051  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 319 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00000219811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 322 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  23.93 
 
 		 438 aa  95.9  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  30.82 
 
 		 298 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_003296  RS04774  hypothetical protein  33.19 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05663  hypothetical protein  33.19 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3215  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906038  normal  0.814855 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  34.55 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4063  beta-lactamase-like  33.51 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4303  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 336 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.71602  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  34.57 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4303  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 319 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.491104 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1711  Beta-lactamase-like  32.98 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4197  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 		 339 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216632  normal  0.10176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  33.51 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  34.73 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  33.04 
 
 		 315 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  32.46 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  33.72 
 
 		 318 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0734  beta-lactamase domain-containing protein  29.55 
 
 		 343 aa  91.3  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0713703  normal  0.0589281 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  32.02 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  32.41 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2893  beta-lactamase domain protein  31.49 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4660  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.413221  normal  0.152436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4528  beta-lactamase domain protein  32.46 
 
 		 319 aa  89.4  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256187  normal  0.560628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3492  beta-lactamase domain-containing protein  31.67 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  31.84 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  29.89 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  27.6 
 
 		 337 aa  87.4  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  31.09 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  28.25 
 
 		 312 aa  85.9  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 		 597 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  31.06 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3062  beta-lactamase domain-containing protein  30.39 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  29.78 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0578  beta-lactamase domain-containing protein  32.16 
 
 		 313 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  21.96 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1125  beta-lactamase domain protein  31.76 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.404195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  26.17 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  30.19 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1344  beta-lactamase domain protein  32.77 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  32.23 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  25.39 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1300  beta-lactamase domain-containing protein  31.35 
 
 		 264 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.862456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  27.06 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  27.05 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 342 aa  80.5  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>