65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5924 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  100 
 
 		 239 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  71.64 
 
 		 285 aa  359  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  63.72 
 
 		 223 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  65.14 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  62.9 
 
 		 246 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  60.54 
 
 		 242 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  34.69 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  36.36 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  39.77 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  38.82 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  34.08 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  36.72 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  35.07 
 
 		 228 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  36.53 
 
 		 212 aa  112  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  35.71 
 
 		 230 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  37.06 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  33.49 
 
 		 216 aa  95.1  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  33.33 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  35.2 
 
 		 204 aa  90.1  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  35.2 
 
 		 216 aa  89.7  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0062  OstA family protein  34.44 
 
 		 204 aa  88.2  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  30.88 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  31.72 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  29.41 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  26.9 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  31.88 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  31.93 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  28.74 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  28.74 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  25.86 
 
 		 180 aa  62  0.000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2341  OstA-like protein  30.41 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  29.19 
 
 		 170 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  29.01 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  24.86 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  29.31 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4314  OstA family protein  25 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2905  OstA family protein  26.21 
 
 		 173 aa  55.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0396  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  21.89 
 
 		 170 aa  54.7  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  24.57 
 
 		 167 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0336  OstA family protein  35.65 
 
 		 362 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0497543  normal  0.164761 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  27.69 
 
 		 161 aa  53.1  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  28.57 
 
 		 182 aa  52  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.57 
 
 		 182 aa  52  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1672  OstA family protein  34.09 
 
 		 323 aa  52  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  25.33 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  27.03 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  21.64 
 
 		 179 aa  50.1  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0012  hypothetical protein  28.12 
 
 		 323 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.541863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  23.46 
 
 		 174 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0508  OstA family protein  25.61 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.346357  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3392  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.44 
 
 		 162 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  21.18 
 
 		 182 aa  46.6  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1235  Organic solvent tolerance protein  30.59 
 
 		 705 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2864  organic solvent tolerance protein  41.67 
 
 		 787 aa  45.8  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000318031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4300  OstA family protein  31.11 
 
 		 181 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4322  OstA family protein  30.36 
 
 		 181 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0867  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.44 
 
 		 162 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0429  OstA family protein  23.56 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.034618 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4169  hypothetical protein  30 
 
 		 180 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  21.82 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0368  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.35 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.166234 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  26.98 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57920  hypothetical protein  25.52 
 
 		 175 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  25 
 
 		 179 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5033  hypothetical protein  26.88 
 
 		 175 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0234887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>