32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5923 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5923  protein of unknown function DUF1239  100 
 
 		 240 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5274  hypothetical protein  82.08 
 
 		 245 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2498  hypothetical protein  53.33 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.238493  normal  0.312198 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2721  protein of unknown function DUF1239  53.33 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.0594287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2426  protein of unknown function DUF1239  55.79 
 
 		 253 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.289708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5468  hypothetical protein  52.38 
 
 		 239 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.131274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0124  hypothetical protein  40.28 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0169027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0178  hypothetical protein  38.95 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0526761  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0156  protein of unknown function DUF1239  38.19 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.535072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0172  hypothetical protein  37.89 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.980945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0418  hypothetical protein  36.92 
 
 		 244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0658  hypothetical protein  35.9 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0175  hypothetical protein  35.2 
 
 		 256 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0048  protein of unknown function DUF1239  33.67 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0150  hypothetical protein  37.2 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.211696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0155  hypothetical protein  37.2 
 
 		 217 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0571  hypothetical protein  29.53 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0167  hypothetical protein  35.12 
 
 		 237 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0067  hypothetical protein  34.8 
 
 		 306 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.690329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0061  protein of unknown function DUF1239  32.5 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0018  hypothetical protein  29.41 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0195  hypothetical protein  30.73 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296411  normal  0.846633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0408  hypothetical protein  28.87 
 
 		 221 aa  93.2  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0045  protein of unknown function DUF1239  31.47 
 
 		 221 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.140568 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1370  hypothetical protein  25.13 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3670  hypothetical protein  28.64 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3250  hypothetical protein  26.06 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0108  hypothetical protein  32.02 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.760602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1691  hypothetical protein  27.49 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1671  hypothetical protein  29.33 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.593803  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0013  hypothetical protein  26.34 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4955  hypothetical protein  28.81 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>