117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5914 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5914  Asp/Glu/hydantoin racemase  100 
 
 
241 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5283  Asp/Glu/hydantoin racemase  78.51 
 
 
241 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.203611 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5846  Asp/Glu/hydantoin racemase  60.25 
 
 
249 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5137  Asp/Glu/hydantoin racemase  65.56 
 
 
239 aa  223  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3273  Asp/Glu racemase  48.47 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325881  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1006  Asp/Glu racemase  46.12 
 
 
246 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719563  hitchhiker  0.00113636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1556  Asp/Glu racemase  52.41 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  41.15 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  38.62 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.5 
 
 
256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2468  Asp/Glu racemase  46.75 
 
 
250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  36.92 
 
 
279 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.69 
 
 
245 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.69 
 
 
245 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  37.75 
 
 
251 aa  120  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  37.7 
 
 
249 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  36.68 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  36.48 
 
 
245 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  35.51 
 
 
245 aa  116  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.55 
 
 
250 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  35.02 
 
 
243 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.24 
 
 
250 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3382  hydantoin racemase  39.91 
 
 
229 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  36.1 
 
 
234 aa  101  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  34.62 
 
 
247 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  34.55 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.33 
 
 
245 aa  95.1  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  32.88 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.82 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  33.05 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.92 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3190  hypothetical protein  34.85 
 
 
216 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  33.64 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  33.18 
 
 
263 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  33.99 
 
 
238 aa  89.4  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  33.18 
 
 
263 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  33.18 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  32.72 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.72 
 
 
278 aa  89  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.72 
 
 
263 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  28.7 
 
 
240 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  28.7 
 
 
240 aa  85.1  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.24 
 
 
245 aa  85.1  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  32.26 
 
 
288 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.7 
 
 
240 aa  85.1  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.1 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  28.26 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  30.7 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  28.02 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.26 
 
 
288 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  34.56 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0955  hydantoin racemase  31.73 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4294  Asp/Glu racemase  39.71 
 
 
252 aa  79  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  31.22 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.5 
 
 
244 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0677  putative hydantoin racemase protein  32.34 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0966453  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.41 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.7 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  31.22 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  31.34 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  31.34 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1238  putative racemase  31.51 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205483  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  31.34 
 
 
318 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  28.84 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  31.34 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  31.34 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  31.34 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  31.34 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  31.78 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  29.73 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3409  hypothetical protein  34.13 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  34.95 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  28.71 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.14 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.31 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0971  Asp/Glu racemase  32.02 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0912948  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  39.9 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1409  Asp/Glu racemase  26.64 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0168107  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.19 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  31.58 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  29.76 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.63 
 
 
247 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3417  Asp/Glu racemase  32.45 
 
 
252 aa  72  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.27 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.63 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  29.72 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  29.67 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  29.67 
 
 
242 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5144  Asp/Glu racemase  33.01 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238464  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  26.32 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.34 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  30.14 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  34.05 
 
 
205 aa  65.9  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  32.75 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4026  hydantoin racemase  27.94 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.997842 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  34.38 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  25.82 
 
 
236 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  30.91 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  30.91 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  30.91 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>