More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5912 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  71.65 
 
 		 478 aa  662    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  89.01 
 
 		 524 aa  820    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  70.13 
 
 		 487 aa  655    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  69.91 
 
 		 500 aa  654    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 493 aa  978    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  67.53 
 
 		 494 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  47.15 
 
 		 516 aa  403  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  47.15 
 
 		 520 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  43.95 
 
 		 496 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  42.26 
 
 		 488 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  44.99 
 
 		 514 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  42.51 
 
 		 503 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  41.67 
 
 		 497 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  45.5 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  41.6 
 
 		 505 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  43.55 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  41.76 
 
 		 475 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  41.53 
 
 		 493 aa  349  8e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  41.53 
 
 		 476 aa  345  8.999999999999999e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  38.51 
 
 		 480 aa  317  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  37.63 
 
 		 503 aa  316  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  37.65 
 
 		 513 aa  309  6.999999999999999e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  40.23 
 
 		 513 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  40 
 
 		 482 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  38.3 
 
 		 504 aa  296  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  35.4 
 
 		 471 aa  282  1e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  34.77 
 
 		 513 aa  216  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  33 
 
 		 493 aa  203  7e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  31.88 
 
 		 479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  32.07 
 
 		 490 aa  177  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1042  peptidase M48 Ste24p  31.56 
 
 		 489 aa  173  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1046  peptidase M48 Ste24p  31.45 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.615139  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0985  peptidase M48, Ste24p  31.85 
 
 		 489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.932429  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  30.81 
 
 		 489 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  30.13 
 
 		 513 aa  157  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  29.93 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  35.45 
 
 		 492 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1755  peptidase M48 Ste24p  26.59 
 
 		 493 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  24.95 
 
 		 479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  35.95 
 
 		 494 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  28.18 
 
 		 479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  36.67 
 
 		 278 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  35.12 
 
 		 284 aa  106  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  35.48 
 
 		 289 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  32.61 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1212  Zn-dependent protease, putative  32.53 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000776404  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  34.74 
 
 		 484 aa  101  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  38.42 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  35.23 
 
 		 266 aa  100  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  36.56 
 
 		 264 aa  99.8  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  38.37 
 
 		 269 aa  99.8  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  34.05 
 
 		 279 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  30.89 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  38.04 
 
 		 315 aa  99.8  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  34.05 
 
 		 279 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  35.08 
 
 		 269 aa  98.6  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  34.42 
 
 		 275 aa  98.2  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  32.98 
 
 		 269 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  36.19 
 
 		 529 aa  97.8  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  32.98 
 
 		 269 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  32.98 
 
 		 269 aa  97.8  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  35.18 
 
 		 266 aa  97.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  34.18 
 
 		 280 aa  97.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  31.13 
 
 		 424 aa  97.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  37.79 
 
 		 269 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  37.79 
 
 		 269 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  37.79 
 
 		 269 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  31.37 
 
 		 494 aa  96.7  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 270 aa  96.7  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 293 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  34.03 
 
 		 278 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  34.39 
 
 		 262 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0233  peptidase M48 Ste24p  32.54 
 
 		 289 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  32.32 
 
 		 282 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  38.37 
 
 		 269 aa  95.5  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  33.8 
 
 		 270 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  34.87 
 
 		 266 aa  95.1  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  30.43 
 
 		 561 aa  94.4  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  30.84 
 
 		 554 aa  94.4  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  33.16 
 
 		 320 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  36 
 
 		 263 aa  94.4  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  32.99 
 
 		 266 aa  93.2  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  33.7 
 
 		 292 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  33.61 
 
 		 502 aa  92.8  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  33.71 
 
 		 288 aa  92  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  34.03 
 
 		 231 aa  92.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  33.53 
 
 		 294 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0222  peptidase M48 Ste24p  35.48 
 
 		 289 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  29.95 
 
 		 553 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  26.42 
 
 		 268 aa  91.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  27.52 
 
 		 268 aa  92.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  29.76 
 
 		 268 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  29.96 
 
 		 568 aa  90.9  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  35.56 
 
 		 560 aa  90.9  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  33.89 
 
 		 264 aa  90.9  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  35.56 
 
 		 572 aa  90.5  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  35.91 
 
 		 259 aa  90.5  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  35.56 
 
 		 572 aa  90.5  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>