24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5897 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5897  protein of unknown function DUF1643  100 
 
 		 183 aa  359  2e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5309  hypothetical protein  72.83 
 
 		 225 aa  239  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0321516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5745  hypothetical protein  50.56 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4066  hypothetical protein  32.61 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.982882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0083  hypothetical protein  32.76 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4033  hypothetical protein  35.62 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.773314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3746  hypothetical protein  30.12 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000131898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2963  hypothetical protein  27.38 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.280917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3032  protein of unknown function DUF1643  31.61 
 
 		 337 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0234736  normal  0.151204 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2920  hypothetical protein  33.73 
 
 		 169 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.8287  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1928  hypothetical protein  29.68 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00260784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2367  hypothetical protein  31.21 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1110  hypothetical protein  30.91 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2772  hypothetical protein  30.91 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5791  hypothetical protein  26.19 
 
 		 155 aa  48.5  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.827947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04721  hypothetical protein  27.17 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0362408  normal  0.769212 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5873  hypothetical protein  31.52 
 
 		 208 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2474  protein of unknown function DUF1643  32.05 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5473  hypothetical protein  31.52 
 
 		 208 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06761  hypothetical protein  33.13 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2991  conserved hypothetical protein DUF1643  30.3 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.47572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1722  hypothetical protein  28.83 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5660  protein of unknown function DUF1643  32.05 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163406 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0031  hypothetical protein  29.27 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00242203  normal  0.074145 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>