71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5750 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  80.69 
 
 		 3521 aa  5445    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  65.29 
 
 		 3238 aa  2492    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  54.31 
 
 		 3006 aa  2803    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  60.4 
 
 		 2900 aa  3043    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  61.63 
 
 		 2899 aa  3104    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 3286 aa  6585    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  74.25 
 
 		 2140 aa  2082    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6221  hypothetical protein  59.87 
 
 		 729 aa  661    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  38.25 
 
 		 1100 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  38.43 
 
 		 1051 aa  486  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  38.69 
 
 		 1101 aa  465  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  36.83 
 
 		 1543 aa  463  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  38.55 
 
 		 1092 aa  463  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  37.27 
 
 		 1133 aa  457  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  37.2 
 
 		 1103 aa  426  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  35.38 
 
 		 1219 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  35.38 
 
 		 1221 aa  417  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  35.2 
 
 		 1067 aa  407  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  33.16 
 
 		 1061 aa  404  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  34.34 
 
 		 1341 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  33.15 
 
 		 1816 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  36.35 
 
 		 1120 aa  397  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  33.86 
 
 		 1188 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  36.28 
 
 		 1137 aa  394  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  35.99 
 
 		 1120 aa  394  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  36.09 
 
 		 1159 aa  393  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  35.87 
 
 		 1132 aa  390  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  35.69 
 
 		 1159 aa  389  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  35.01 
 
 		 1116 aa  387  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  36.05 
 
 		 1132 aa  388  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1132 aa  388  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  34.86 
 
 		 1116 aa  385  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3248  hypothetical protein  66.15 
 
 		 425 aa  384  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1158 aa  384  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  36.05 
 
 		 1158 aa  384  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1157 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  33.2 
 
 		 1057 aa  376  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  33.03 
 
 		 1194 aa  374  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  35.29 
 
 		 1157 aa  369  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  35.65 
 
 		 1159 aa  366  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1159 aa  367  3e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  34.88 
 
 		 1157 aa  365  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  31.99 
 
 		 2007 aa  360  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  31.19 
 
 		 1059 aa  332  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  37.67 
 
 		 1012 aa  330  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  38.39 
 
 		 522 aa  324  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  35.81 
 
 		 881 aa  231  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  36.91 
 
 		 951 aa  189  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3247  hypothetical protein  42.31 
 
 		 287 aa  172  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  33 
 
 		 837 aa  161  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  26.21 
 
 		 960 aa  149  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  31.38 
 
 		 1564 aa  144  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  27.02 
 
 		 2196 aa  131  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  24.73 
 
 		 1171 aa  87  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1315  Hedgehog/intein hint domain protein  36.24 
 
 		 1115 aa  84  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  24.63 
 
 		 918 aa  81.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  22.78 
 
 		 1644 aa  79  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3558  hypothetical protein  23.43 
 
 		 1172 aa  65.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3499  hypothetical protein  34.31 
 
 		 833 aa  59.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5439  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1172 aa  59.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.861943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1851  hypothetical protein  32.75 
 
 		 270 aa  59.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459823  normal  0.905068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4217  hypothetical protein  29.41 
 
 		 284 aa  54.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1764  hypothetical protein  31.72 
 
 		 771 aa  54.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0992615  normal  0.125596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1315  hypothetical protein  30.05 
 
 		 702 aa  54.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1270  hypothetical protein  38.89 
 
 		 762 aa  53.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3893  hypothetical protein  38.89 
 
 		 762 aa  53.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1446  fibronectin, type III domain-containing protein  26.83 
 
 		 1089 aa  51.2  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  32.04 
 
 		 1351 aa  49.3  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1850  hypothetical protein  30.59 
 
 		 417 aa  49.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0064  hypothetical protein  32.99 
 
 		 763 aa  47.8  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00226293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3342  hypothetical protein  44.64 
 
 		 849 aa  47.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.696824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>