282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5554 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5321  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5554  50S ribosomal protein L35  100 
 
 		 66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.089487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3152  50S ribosomal protein L35  95.45 
 
 		 67 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1909  50S ribosomal protein L35  95.38 
 
 		 67 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1627  50S ribosomal protein L35  95.38 
 
 		 67 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0528958  hitchhiker  0.00478597 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1609  50S ribosomal protein L35  93.85 
 
 		 67 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.188656  normal  0.0147184 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1835  50S ribosomal protein L35  83.33 
 
 		 66 aa  114  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0519771 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3042  50S ribosomal protein L35  77.27 
 
 		 66 aa  107  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0216  50S ribosomal protein L35  77.27 
 
 		 66 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0449  50S ribosomal protein L35  77.27 
 
 		 66 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0076  50S ribosomal protein L35  77.27 
 
 		 66 aa  103  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0068  50S ribosomal protein L35  77.27 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.5109  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0040  50S ribosomal protein L35  74.24 
 
 		 66 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0043  50S ribosomal protein L35  74.24 
 
 		 66 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0166  50S ribosomal protein L35  74.24 
 
 		 66 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.426785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1933  ribosomal protein L35  72.73 
 
 		 403 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317128  normal  0.0648736 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0205  50S ribosomal protein L35  69.7 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0218  ribosomal protein L35  70.31 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2119  50S ribosomal protein L35  71.21 
 
 		 66 aa  87.4  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0517001  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0801  50S ribosomal protein L35  69.7 
 
 		 66 aa  87  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2034  hypothetical protein  71.21 
 
 		 123 aa  86.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4268  50S ribosomal protein L35  69.7 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1315  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0128  50S ribosomal protein L35P  71.21 
 
 		 66 aa  85.9  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0134182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3484  50S ribosomal protein L35  68.18 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4533  50S ribosomal protein L35  66.67 
 
 		 67 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2514  50S ribosomal protein L35  69.35 
 
 		 66 aa  80.5  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0230  50S ribosomal protein L35  69.35 
 
 		 66 aa  80.1  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0450  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 66 aa  80.1  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2274  50S ribosomal protein L35  61.54 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.5439  normal  0.30406 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1765  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0411  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2487  50S ribosomal protein L35  62.9 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0673  50S ribosomal protein L35P  61.29 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2432  50S ribosomal protein L35  60.61 
 
 		 67 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2940  50S ribosomal protein L35  57.58 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.754821 
 
 
-
 
NC_002978  WD0864  50S ribosomal protein L35  56.25 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0685  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513198  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0198  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 66 aa  67.8  0.00000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0135  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 66 aa  67  0.00000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3091  50S ribosomal protein L35  57.38 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.0357819 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2922  50S ribosomal protein L35  55.74 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2155  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000190573  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2460  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  51.61 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  55.93 
 
 		 65 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1481  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000160361 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1478  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0232172  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  54.24 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1192  50S ribosomal protein L35  51.52 
 
 		 66 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4143  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000359181  hitchhiker  0.000240129 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22420  LSU ribosomal protein L35P  46.77 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2847  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.161293  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  47.62 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14580  50S ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  57.8  0.00000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05730  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000571086  normal  0.0115615 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1104  ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.124943  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3168  ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.422818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  50.85 
 
 		 65 aa  57  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1625  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.516266 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  50.79 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3521  50S ribosomal protein L35P  51.52 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0090517  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  48.39 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  46.97 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2980  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415069  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2995  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138749  normal  0.047682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3024  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.584231 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0535  ribosomal protein L35  46.03 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000240133  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5482  ribosomal protein L35  40.32 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3181  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340502  normal  0.163577 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0214  ribosomal protein L35  56 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0660989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1881  50S ribosomal protein L35  53.97 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0627786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3327  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797164  normal  0.341501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5472  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3070  ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25680  50S ribosomal protein L35  41.94 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2417  ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15190  LSU ribosomal protein L35P  50 
 
 		 65 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00179087  normal  0.120131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1974  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1904  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1989  50S ribosomal protein L35  52.38 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0980049  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  50 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  42.19 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3541  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.47075  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  45.16 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  43.55 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  46.88 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>