More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5531 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 158 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  82.91 
 
 		 160 aa  226  9e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  72.85 
 
 		 157 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  75.51 
 
 		 157 aa  214  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  72.73 
 
 		 157 aa  214  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 168 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  35.38 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 173 aa  68.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 303 aa  67.4  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 166 aa  67  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  31.43 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  39.57 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4366  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 165 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  40.37 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  33.63 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  38.74 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  40.21 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  35.79 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4869  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 136 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4754  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 165 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  33.83 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5154  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07865e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  39.78 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  39.17 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4909  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5199  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.364605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4773  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  36.26 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5284  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 152 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3927  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>