More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5524 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
263 aa  517  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1831  enoyl-CoA hydratase  67.82 
 
 
261 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.728696  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0903  enoyl-CoA hydratase  68.6 
 
 
276 aa  331  8e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0681  enoyl-CoA hydratase  73.28 
 
 
263 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  63.12 
 
 
263 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  63.5 
 
 
263 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  63.12 
 
 
263 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  62.98 
 
 
263 aa  322  4e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4154  enoyl-CoA hydratase  64.37 
 
 
263 aa  321  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190169  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  63.08 
 
 
262 aa  318  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  59.54 
 
 
263 aa  318  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  62.02 
 
 
260 aa  317  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  61.92 
 
 
262 aa  301  9e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  61.54 
 
 
262 aa  300  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  60.98 
 
 
280 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  61.15 
 
 
262 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  61.15 
 
 
262 aa  296  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  59.51 
 
 
263 aa  295  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 
263 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 
263 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 
263 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 
263 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 
263 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 
263 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  59.92 
 
 
263 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3363  enoyl-CoA hydratase  67.31 
 
 
261 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  58.94 
 
 
263 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  54.37 
 
 
263 aa  280  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3628  enoyl-CoA hydratase  63.16 
 
 
263 aa  278  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00340574  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0446  enoyl-CoA hydratase  63.01 
 
 
263 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0656  enoyl-CoA hydratase  57.75 
 
 
262 aa  276  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0471  enoyl-CoA hydratase  63.16 
 
 
263 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0802767  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0513  enoyl-CoA hydratase  61.6 
 
 
263 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  0.618251 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0438  enoyl-CoA hydratase  57.09 
 
 
261 aa  275  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.658652  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2853  enoyl-CoA hydratase  63.16 
 
 
263 aa  274  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00948295  normal  0.659081 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2564  enoyl-CoA hydratase  60.8 
 
 
263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0541  enoyl-CoA hydratase  60.8 
 
 
263 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.306395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  53.78 
 
 
264 aa  272  5.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0468  enoyl-CoA hydratase  61.94 
 
 
263 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1512  enoyl-CoA hydratase  54.03 
 
 
264 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.288144  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2691  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 
263 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103859  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  50.96 
 
 
262 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3015  enoyl-CoA hydratase  63.16 
 
 
274 aa  262  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  54.47 
 
 
261 aa  260  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3115  enoyl-CoA hydratase  57.25 
 
 
262 aa  255  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000284376  normal  0.0714988 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2873  enoyl-CoA hydratase  57.63 
 
 
262 aa  255  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00237837  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2750  enoyl-CoA hydratase  57.63 
 
 
262 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00030401  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3488  enoyl-CoA hydratase  61.13 
 
 
263 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000267739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  52.63 
 
 
263 aa  251  9.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  47.15 
 
 
261 aa  249  4e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.58 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  56.39 
 
 
266 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0568  enoyl-CoA hydratase/isomerase  56.49 
 
 
260 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1551  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  57.03 
 
 
263 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2154  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  51.91 
 
 
258 aa  226  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.182629  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.46 
 
 
270 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1171  enoyl-CoA hydratase/isomerase  55.12 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.372212  normal  0.332854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  48.13 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1238  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.06 
 
 
267 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1715  enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.15 
 
 
264 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.89 
 
 
263 aa  216  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0214768  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1130  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  50.2 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1674  enoyl-CoA hydratase  47.58 
 
 
284 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2405  enoyl-CoA hydratase/isomerase  51.84 
 
 
272 aa  211  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.777114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  46.25 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  48.86 
 
 
260 aa  211  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1862  enoyl-CoA hydratase  45.63 
 
 
266 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0819441  normal  0.192366 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1753  enoyl-CoA hydratase  50.76 
 
 
258 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.228549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.22 
 
 
259 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1958  enoyl-CoA hydratase  45.85 
 
 
266 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  52.76 
 
 
258 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.886446  normal  0.993204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2918  enoyl-CoA hydratase  46.18 
 
 
264 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  51 
 
 
266 aa  205  6e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.01 
 
 
260 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.47 
 
 
258 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.46 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3979  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.09 
 
 
256 aa  200  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.776051  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.76 
 
 
259 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.12 
 
 
258 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.58 
 
 
264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.47 
 
 
268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1911  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.53 
 
 
270 aa  181  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3942  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.1 
 
 
277 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908952  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.32 
 
 
267 aa  178  8e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.72 
 
 
255 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  44.78 
 
 
265 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
265 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1797  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.84 
 
 
261 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3809  enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.86 
 
 
258 aa  175  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.97613  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.98 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1707  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.64 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.349226  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.23 
 
 
273 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  48.18 
 
 
273 aa  169  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.54 
 
 
275 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  43.89 
 
 
261 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2150  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.84 
 
 
274 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00228605  normal  0.0108638 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  38.61 
 
 
265 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
261 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.27 
 
 
260 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.16 
 
 
263 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>