More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5471 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5471  S-adenosyl-methyltransferase MraW  100 
 
 
339 aa  658    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.191975  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0263  S-adenosyl-methyltransferase MraW  85.5 
 
 
337 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0989467  normal  0.0563961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5104  S-adenosyl-methyltransferase MraW  73.27 
 
 
353 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131212  normal  0.927807 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4641  S-adenosyl-methyltransferase MraW  72.97 
 
 
351 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.059697 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5180  S-adenosyl-methyltransferase MraW  73.97 
 
 
351 aa  449  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2365  S-adenosyl-methyltransferase MraW  72.73 
 
 
353 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0749986 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4056  S-adenosyl-methyltransferase MraW  65.37 
 
 
332 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00662143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3402  S-adenosyl-methyltransferase MraW  62.08 
 
 
398 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160139  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1986  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.17 
 
 
337 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376194  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1852  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.66 
 
 
345 aa  342  8e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.787107 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2413  S-adenosyl-methyltransferase MraW  63.12 
 
 
339 aa  332  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.881331  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0958  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.19 
 
 
326 aa  332  8e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0683  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.37 
 
 
331 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856779  normal  0.179081 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0684  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.8 
 
 
355 aa  325  8.000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.206992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0772  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.49 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11947  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6038  S-adenosyl-methyltransferase MraW  59.49 
 
 
331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1439  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.06 
 
 
346 aa  315  7e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464087  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1736  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.75 
 
 
347 aa  315  8e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1396  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.75 
 
 
346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3477  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.27 
 
 
346 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.46 
 
 
322 aa  311  7.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6182  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.84 
 
 
331 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  58.71 
 
 
339 aa  308  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1889  S-adenosyl-methyltransferase MraW  56.27 
 
 
325 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0524165 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2900  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.59 
 
 
341 aa  305  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1271  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.17 
 
 
399 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2086  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.73 
 
 
334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2015  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.87 
 
 
329 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3675  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.02 
 
 
322 aa  297  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2602  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.72 
 
 
341 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.172088  normal  0.713664 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0583  S-adenosyl-methyltransferase MraW  55.31 
 
 
322 aa  292  7e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401485  normal  0.166979 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1043  S-adenosyl-methyltransferase MraW  60.48 
 
 
332 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0955  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.25 
 
 
331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2769  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.38 
 
 
327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66075  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.68 
 
 
362 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2186  S-adenosyl-methyltransferase MraW  61.36 
 
 
330 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.222915  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1125  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.63 
 
 
329 aa  280  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2474  S-adenosyl-methyltransferase MraW  57.23 
 
 
333 aa  278  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.508671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2862  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.78 
 
 
341 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0167683 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0055  S-adenosyl-methyltransferase MraW  54.63 
 
 
313 aa  269  5e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3435  S-adenosyl-methyltransferase MraW  53.82 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.022663  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0761  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.84 
 
 
313 aa  264  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0491  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.19 
 
 
297 aa  263  3e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0770  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.02 
 
 
307 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.910807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1269  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.63 
 
 
316 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0542  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.23 
 
 
297 aa  256  4e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.770048  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0170  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.79 
 
 
314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.225843  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3178  S-adenosyl-methyltransferase MraW  52.75 
 
 
338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.965716 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0766  S-adenosyl-methyltransferase MraW  51.84 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4992  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.48 
 
 
313 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57450  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
313 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04374  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.24 
 
 
347 aa  246  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2622  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.02 
 
 
312 aa  246  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.985865  unclonable  0.00000000000627506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1616  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.58 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3519  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.65 
 
 
337 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3077  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.87 
 
 
311 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0173  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.84 
 
 
316 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.84 
 
 
301 aa  242  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0595  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.27 
 
 
322 aa  241  1e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835578  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0650  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.23 
 
 
520 aa  241  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3982  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.44 
 
 
303 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0500  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.08 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.214758 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0524  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.9 
 
 
317 aa  239  4e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1103  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.51 
 
 
312 aa  238  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000544385  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0454  S-adenosyl-methyltransferase MraW  49.21 
 
 
318 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.835037 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2277  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.24 
 
 
321 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.390656 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1296  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.21 
 
 
315 aa  238  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0914  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.57 
 
 
314 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4520  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.87 
 
 
315 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1329  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.87 
 
 
315 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0341  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.55 
 
 
349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000642562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4395  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.87 
 
 
315 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216905  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3637  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.09 
 
 
313 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0404  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.44 
 
 
313 aa  235  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0981  S-adenosyl-methyltransferase MraW  42.17 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.575492  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1997  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.96 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.573092 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2708  S-adenosyl-methyltransferase MraW  50.16 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00108828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00083  S-adenosyl-methyltransferase  46.18 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3518  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3575  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.723742  hitchhiker  0.000748743 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0084  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.796275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0090  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.929573 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3506  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.86 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0087  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.519171  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0075  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0088  S-adenosyl-methyltransferase MraW  46.18 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0921  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.75 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00082  hypothetical protein  46.18 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_282  S-adenosyl-methyltransferase  44.55 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000442175  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1046  S-adenosyl-methyltransferase MraW  44.05 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2844  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.56 
 
 
313 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.302053  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0733  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.42 
 
 
323 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0144586  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0963  S-adenosyl-methyltransferase MraW  47.42 
 
 
361 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0178075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0936  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.22 
 
 
315 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0347  S-adenosyl-methyltransferase MraW  43.85 
 
 
313 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.790423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0111  methyltransferase  50.48 
 
 
311 aa  232  8.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3778  S-adenosyl-methyltransferase MraW  48.7 
 
 
313 aa  231  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00382948  hitchhiker  0.000103872 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33240  predicted protein  46.33 
 
 
314 aa  231  1e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.143284  normal  0.415774 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0136  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.54 
 
 
313 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130148 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0132  S-adenosyl-methyltransferase MraW  45.54 
 
 
313 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>