More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5377 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  56.25 
 
 		 600 aa  687    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1921  putative inner membrane protein translocase component YidC  61.06 
 
 		 616 aa  755    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.010841  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.82 
 
 		 597 aa  689    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  56.13 
 
 		 610 aa  678    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.23 
 
 		 607 aa  675    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.81 
 
 		 610 aa  677    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  74.15 
 
 		 616 aa  938    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3074  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.11 
 
 		 614 aa  688    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.374984  normal  0.974517 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0455  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.91 
 
 		 620 aa  648    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107055  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  75.53 
 
 		 614 aa  967    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7326  putative inner membrane protein translocase component YidC  53.88 
 
 		 621 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  74.64 
 
 		 616 aa  952    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0683  putative inner membrane protein translocase component YidC  55.64 
 
 		 629 aa  685    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.902315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5377  YidC translocase/secretase  100 
 
 		 605 aa  1237    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0817  putative inner membrane protein translocase component YidC  56.26 
 
 		 632 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.75563 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  75.36 
 
 		 617 aa  976    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.35 
 
 		 597 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0069  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.6 
 
 		 621 aa  670    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.090165  decreased coverage  0.00200731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3703  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.09 
 
 		 609 aa  676    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3328  60 kDa inner membrane insertion protein  60.03 
 
 		 604 aa  738    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348306  normal  0.0506937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0376  putative inner membrane protein translocase component YidC  52.44 
 
 		 609 aa  637    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388979  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5081  60 kDa inner membrane insertion protein  87.98 
 
 		 624 aa  1126    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373544  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0095  putative inner membrane protein translocase component YidC  54.46 
 
 		 597 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.10916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0636  putative inner membrane protein translocase component YidC  56 
 
 		 622 aa  670    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  51.91 
 
 		 609 aa  630  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3339  putative inner membrane protein translocase component YidC  51.41 
 
 		 595 aa  616  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978164  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1048  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.6 
 
 		 612 aa  588  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0029293  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2725  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.62 
 
 		 623 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0447899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1064  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.62 
 
 		 623 aa  532  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2869  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.94 
 
 		 628 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0328  putative inner membrane protein translocase component YidC  46 
 
 		 606 aa  525  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0458  protein translocase subunit yidC  44.98 
 
 		 592 aa  521  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  44 
 
 		 635 aa  507  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0640  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.87 
 
 		 630 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.138762  normal  0.404491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  44.48 
 
 		 589 aa  497  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.88 
 
 		 626 aa  494  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0307  putative inner membrane protein translocase component YidC  43.82 
 
 		 608 aa  494  9.999999999999999e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.339153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3617  putative inner membrane protein translocase component YidC  44.97 
 
 		 577 aa  491  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.320662 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.74 
 
 		 584 aa  477  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2141  60 kDa inner membrane insertion protein  43.43 
 
 		 601 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  42.37 
 
 		 600 aa  448  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0782  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.54 
 
 		 579 aa  428  1e-118  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0237  putative inner membrane protein translocase component YidC  41.57 
 
 		 569 aa  422  1e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182056  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0293  putative inner membrane protein translocase component YidC  37.2 
 
 		 579 aa  420  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0402  inner membrane protein, 60 kDa  35.59 
 
 		 566 aa  390  1e-107  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3757  protein translocase subunit yidC  34.18 
 
 		 556 aa  327  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.189784 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2411  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family domain containing  33.45 
 
 		 570 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.705473  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3623  60 kDa inner membrane insertion protein  33.11 
 
 		 542 aa  282  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.45 
 
 		 553 aa  277  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.76 
 
 		 554 aa  272  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0102  60 kDa inner membrane insertion protein  36.09 
 
 		 559 aa  272  1e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.32 
 
 		 567 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4059  60 kDa inner membrane insertion protein  34.77 
 
 		 537 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.082021  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4014  protein translocase subunit yidC  31.42 
 
 		 557 aa  269  8.999999999999999e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4149  60 kDa inner membrane insertion protein  32.93 
 
 		 536 aa  269  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  31.62 
 
 		 552 aa  268  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1230  60 kDa inner membrane insertion protein  31.94 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0120976  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.56 
 
 		 554 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  34 
 
 		 552 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.86 
 
 		 575 aa  266  8.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  34.39 
 
 		 531 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3642  60 kDa inner membrane insertion protein  31.26 
 
 		 530 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0951488  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  33.93 
 
 		 557 aa  265  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  35.95 
 
 		 555 aa  265  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.15 
 
 		 552 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  36.17 
 
 		 555 aa  263  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2139  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.45 
 
 		 550 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  30.45 
 
 		 542 aa  263  6.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  30.47 
 
 		 547 aa  260  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2882  protein translocase subunit yidC  34.07 
 
 		 562 aa  259  9e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.208936  normal  0.460711 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2758  protein translocase subunit yidC  32.78 
 
 		 552 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.174551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.94 
 
 		 560 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.77 
 
 		 560 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.88 
 
 		 550 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52450  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.16 
 
 		 557 aa  255  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  32.64 
 
 		 566 aa  254  2.0000000000000002e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3074  hypothetical protein  30.42 
 
 		 556 aa  254  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.19 
 
 		 581 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4485  60 kDa inner membrane insertion protein  30.11 
 
 		 551 aa  253  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00386094  hitchhiker  0.00000000260158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.32 
 
 		 560 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.32 
 
 		 560 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.8 
 
 		 578 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.53 
 
 		 557 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3087  60 kDa inner membrane insertion protein  30.24 
 
 		 545 aa  252  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.863197  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.2 
 
 		 541 aa  252  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3037  inner membrane protein, 60 kDa  30.27 
 
 		 545 aa  251  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_5012  60 kDa inner membrane insertion protein  32.03 
 
 		 567 aa  251  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  30.42 
 
 		 556 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.37 
 
 		 560 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  32.84 
 
 		 553 aa  251  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2144  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.67 
 
 		 565 aa  250  5e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00651842  unclonable  0.00000165557 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4113  60 kDa inner membrane insertion protein  30.62 
 
 		 569 aa  250  6e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.731862  normal  0.125371 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.59 
 
 		 541 aa  249  7e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 558 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 558 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 558 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 558 aa  249  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.47 
 
 		 578 aa  249  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2394  protein translocase subunit yidC  30.9 
 
 		 536 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000698908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.3 
 
 		 545 aa  249  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>