194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5354 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5354  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  424  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5047  hypothetical protein  87.26 
 
 		 232 aa  350  7e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0759  hypothetical protein  71.03 
 
 		 219 aa  288  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.580871 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  67.31 
 
 		 218 aa  281  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  66.83 
 
 		 218 aa  281  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1107  hypothetical protein  72.04 
 
 		 219 aa  281  7.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2248  hypothetical protein  72.64 
 
 		 220 aa  280  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00723109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  66.83 
 
 		 218 aa  279  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1927  hypothetical protein  72.17 
 
 		 216 aa  278  7e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.383798  normal  0.0886446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1972  hypothetical protein  72.64 
 
 		 216 aa  277  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0043  hypothetical protein  64.65 
 
 		 232 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  62.74 
 
 		 217 aa  254  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  62.26 
 
 		 215 aa  254  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2246  hypothetical protein  59.15 
 
 		 219 aa  250  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0818704 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  60.38 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0253  hypothetical protein  61.75 
 
 		 220 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0318  hypothetical protein  65.58 
 
 		 231 aa  244  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.811126 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0473  hypothetical protein  63.72 
 
 		 225 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.303142  normal  0.215459 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4139  hypothetical protein  58.69 
 
 		 219 aa  234  9e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  56.13 
 
 		 223 aa  232  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0557  hypothetical protein  59.52 
 
 		 218 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  58.37 
 
 		 223 aa  225  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  54.98 
 
 		 216 aa  215  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2163  hypothetical protein  53.3 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1878  methyltransferase-like protein  49.54 
 
 		 214 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627264  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2946  hypothetical protein  52.11 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.669539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3080  hypothetical protein  48.37 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3181  hypothetical protein  48.37 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3111  hypothetical protein  48.1 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1573  methyltransferase type 12  50.47 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.973711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1522  methyltransferase small  50.71 
 
 		 222 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2983  hypothetical protein  48.37 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.651745  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2021  methyltransferase small  52.06 
 
 		 221 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1825  methyltransferase small  46.95 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0056314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3352  methyltransferase small  46.04 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.054842  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3122  methyltransferase small  46.04 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  0.652615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  37.64 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  37.64 
 
 		 217 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  38.65 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  40.65 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  40 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  36.6 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  42.58 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  39.35 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  41.94 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  45.26 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  33.55 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  33.85 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  32.02 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  33.08 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3618  methyltransferase type 12  39.49 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.971669  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  29.67 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  31.34 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3320  ribosomal protein L11 methyltransferase, putative  38.1 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 316 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  25.76 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  28.02 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  33.01 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  28.46 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0996  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.85 
 
 		 305 aa  52.8  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  41.33 
 
 		 338 aa  52.8  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0465  ribosomal L11 methyltransferase  36.63 
 
 		 292 aa  52  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0951  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 294 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  28.88 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3208  ribosomal protein L11 methyltransferase  47.46 
 
 		 300 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0770215  decreased coverage  0.00369905 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  31.29 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  29.85 
 
 		 249 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  35.29 
 
 		 318 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.59 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  27.34 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  30.77 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0136  ribosomal L11 methyltransferase  38 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000366624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38927  predicted protein  29.85 
 
 		 300 aa  48.9  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.67 
 
 		 308 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  33.33 
 
 		 285 aa  48.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0447  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.5 
 
 		 299 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.79 
 
 		 304 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  29.51 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4297  ribosomal protein L11 methyltransferase  50.88 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000247915  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  28 
 
 		 312 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  46.55 
 
 		 426 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.74 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  33.76 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0608  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  44.26 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217984  hitchhiker  0.0000000198415 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0225  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.71 
 
 		 306 aa  47.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3772  Methylase of polypeptide chain release factors- like protein  37.65 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.512138 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3687  ribosomal protein L11 methyltransferase  41.03 
 
 		 295 aa  46.6  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.768619  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  32.11 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4383  homocysteine S-methyltransferase  33.61 
 
 		 578 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  29.66 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3447  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  29.11 
 
 		 353 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00223061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  25 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.65 
 
 		 286 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4421  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.74 
 
 		 293 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00260494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3987  ribosomal protein L11 methyltransferase  50 
 
 		 301 aa  45.8  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000114299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1648  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.99 
 
 		 308 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.411566  hitchhiker  0.000715669 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0828  hypothetical protein  29.11 
 
 		 353 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1470  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.99 
 
 		 308 aa  45.8  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.456616  unclonable  0.00000118267 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  44.44 
 
 		 294 aa  45.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3219  ribosomal protein L11 methyltransferase  43.33 
 
 		 307 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000607744  hitchhiker  0.0000170628 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>