More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5344 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 216 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  83.8 
 
 		 216 aa  352  2e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  44.61 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 258 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  47.5 
 
 		 238 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  47.5 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 226 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 226 aa  154  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 249 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  40.57 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 226 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  33.82 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 219 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3249  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 215 aa  104  8e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3658  GntR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 245 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0786  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 253 aa  99  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000452632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 237 aa  99  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3731  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 229 aa  96.7  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0046  regulatory protein GntR, HTH  37.58 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  95.5  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 235 aa  95.5  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  25.39 
 
 		 215 aa  93.2  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 255 aa  93.2  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  37.91 
 
 		 239 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5572  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 244 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 219 aa  91.7  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 228 aa  91.3  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3761  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 247 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 247 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 264 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  32.84 
 
 		 246 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  39.01 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 254 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8055  transcriptional regulator, GntR family  33.81 
 
 		 250 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 238 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1109  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 230 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 254 aa  89  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.7 
 
 		 223 aa  89  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 247 aa  88.6  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  33.98 
 
 		 218 aa  88.6  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2118  GntR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 233 aa  88.2  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.654279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 235 aa  88.2  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5794  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 216 aa  88.2  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.499675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2211  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153172  decreased coverage  0.00038585 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3321  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.216307  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3706  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 244 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  32.52 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 245 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  34.69 
 
 		 293 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 219 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 243 aa  85.5  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 212 aa  85.1  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  32.83 
 
 		 246 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 260 aa  84.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  34.13 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 219 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  30.1 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>