114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5336 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  73.54 
 
 
479 aa  706    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
495 aa  978    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  54.77 
 
 
718 aa  349  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0899  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  53.41 
 
 
713 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935654  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2846  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  52.25 
 
 
708 aa  341  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7623  hypothetical protein  54.84 
 
 
619 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0861286  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  58.15 
 
 
818 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  58.33 
 
 
784 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  57.89 
 
 
988 aa  251  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  55.46 
 
 
1056 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  57.64 
 
 
1022 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  57.02 
 
 
1056 aa  247  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  54.71 
 
 
778 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  53.57 
 
 
839 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  47.51 
 
 
629 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7203  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.7 
 
 
859 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0476078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0920  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.86 
 
 
680 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.800014 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.15 
 
 
485 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.56 
 
 
860 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42 
 
 
445 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4354  hypothetical protein  40.87 
 
 
477 aa  170  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4352  hypothetical protein  35.8 
 
 
486 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1326  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.11 
 
 
728 aa  162  9e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5561  caspase-like domain-containing protein  34.75 
 
 
576 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2162  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  39.42 
 
 
472 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0611523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.18 
 
 
554 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.54 
 
 
481 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.33 
 
 
515 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  41.92 
 
 
485 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  39.84 
 
 
449 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  39.57 
 
 
499 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35 
 
 
478 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2884  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.86 
 
 
1155 aa  151  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158927 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1080  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.67 
 
 
502 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3482  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.51 
 
 
490 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.268767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.9 
 
 
486 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3497  caspase-1, p20  33.05 
 
 
971 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3142  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.28 
 
 
971 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.089148 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  35.5 
 
 
276 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.13 
 
 
522 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  38.22 
 
 
489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4521  caspase-like domain-containing protein  34.44 
 
 
798 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.12 
 
 
421 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2462  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.5 
 
 
649 aa  133  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10862  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0960  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.62 
 
 
862 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.355322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0137  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.59 
 
 
915 aa  130  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.193132  normal  0.854443 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0307  hypothetical protein  38.28 
 
 
472 aa  127  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3731  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.75 
 
 
652 aa  125  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.016109  normal  0.736011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3036  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.29 
 
 
295 aa  121  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1009  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.17 
 
 
528 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.781757  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3269  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.49 
 
 
828 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336347  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5158  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.89 
 
 
474 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.927175  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3029  peptidase C14  37.23 
 
 
527 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.148896  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0897  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.43 
 
 
541 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.82 
 
 
766 aa  118  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3182  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.22 
 
 
1026 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.740099  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.4 
 
 
479 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.83 
 
 
504 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0910  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.95 
 
 
553 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354692  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  30.81 
 
 
657 aa  113  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3606  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.76 
 
 
292 aa  111  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.222651  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0290  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.78 
 
 
776 aa  110  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106858  hitchhiker  0.00955586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0548  putative peptidase  34.91 
 
 
287 aa  108  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0554  caspase-like domain- and TPR repeat-containing peptidase  33.33 
 
 
518 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.463703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5502  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.31 
 
 
813 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  32.38 
 
 
482 aa  107  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4626  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.39 
 
 
291 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  30 
 
 
500 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1332  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.26 
 
 
824 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  35.62 
 
 
523 aa  104  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  29.45 
 
 
654 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  28.92 
 
 
616 aa  103  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6467  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.4 
 
 
511 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.38 
 
 
502 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.2 
 
 
499 aa  98.6  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0784  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.19 
 
 
291 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0861  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.16 
 
 
288 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  33.07 
 
 
570 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.38 
 
 
501 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1734  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.04 
 
 
570 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.055042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.88 
 
 
442 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  32.59 
 
 
535 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4686  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.74 
 
 
289 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.43 
 
 
497 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.56 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.51 
 
 
798 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.88 
 
 
316 aa  63.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  30 
 
 
328 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  27.95 
 
 
902 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  30.94 
 
 
331 aa  57.4  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  28.57 
 
 
781 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.29 
 
 
324 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.88 
 
 
324 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.24 
 
 
1088 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.19 
 
 
477 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  33.61 
 
 
544 aa  53.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5335  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
2050 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.79 
 
 
464 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.18 
 
 
316 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.59 
 
 
658 aa  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>