More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5248 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 172 aa  328  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  69.33 
 
 		 175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  59.51 
 
 		 176 aa  191  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  57.31 
 
 		 174 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  55.76 
 
 		 169 aa  168  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  34.42 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 181 aa  94.4  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  34.84 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3181  regulatory protein, MarR  32.87 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 162 aa  73.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 173 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 167 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  36.43 
 
 		 201 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1784  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  33.81 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  39.57 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  33.08 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  26.53 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  39.07 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 200 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  26.92 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  26.92 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  28.75 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 137 aa  60.8  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  28.75 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  26.92 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  26.92 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  26.92 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  28.75 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  28.75 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  26.92 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  34.93 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  28.75 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1495  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  27.89 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  38.94 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  26.92 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  37.74 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  34.93 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  26.92 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  41.12 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  42.68 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>