52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5221 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5221  Heparinase II/III family protein  100 
 
 		 573 aa  1132    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452357  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2790  Heparinase II/III family protein  61.04 
 
 		 570 aa  645    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2567  heparinase II/III family protein  61.04 
 
 		 570 aa  645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5592  heparinase II/III family protein  63.99 
 
 		 582 aa  654    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.658626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2964  heparinase II/III family protein  87.59 
 
 		 573 aa  971    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534511  normal  0.040363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2499  Heparinase II/III family protein  62.43 
 
 		 570 aa  662    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307447  normal  0.508108 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0157  heparinase II/III-like  48.77 
 
 		 584 aa  474  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.901723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0718  heparinase II/III-like  46.9 
 
 		 628 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.79901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0324  hypothetical protein  47.28 
 
 		 571 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.674427  normal  0.116041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0024  heparinase II/III-like  46.85 
 
 		 592 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0196  heparinase II/III-like  47.68 
 
 		 584 aa  458  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.9561  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0030  Heparinase II/III family protein  47.17 
 
 		 584 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0085  heparinase II/III-like  47.33 
 
 		 584 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265496  normal  0.158685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0039  heparinase II/III family protein  49.16 
 
 		 614 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.644544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1423  Heparinase II/III family protein  49.72 
 
 		 569 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.332975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2070  heparinase II/III family protein  49.53 
 
 		 581 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3419  heparinase II/III-like  45.15 
 
 		 568 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.784393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1088  heparinase II/III family protein  43.77 
 
 		 580 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1815  hypothetical protein  43.67 
 
 		 543 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.277258  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1748  hypothetical protein  42.91 
 
 		 617 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.560293  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0073  heparinase II/III-like family protein  37.61 
 
 		 569 aa  348  1e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.000000000168541  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3190  heparinase II/III family protein  39.41 
 
 		 568 aa  326  6e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4294  hypothetical protein  38.22 
 
 		 518 aa  325  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166644  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3916  Heparinase II/III family protein  39.03 
 
 		 548 aa  319  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.729618  normal  0.655355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4241  Heparinase II/III family protein  38.25 
 
 		 548 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.222931 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1321  heparinase II/III family protein  38.82 
 
 		 629 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.213971  hitchhiker  0.0000000859361 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2926  heparinase II/III family protein  34.34 
 
 		 610 aa  250  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0023  heparinase II/III family protein  33.88 
 
 		 524 aa  208  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0625  Heparinase II/III family protein  32.14 
 
 		 597 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.27993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3127  heparinase II/III-like protein  30.92 
 
 		 592 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4041  heparinase II/III-like  31.02 
 
 		 584 aa  170  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0090  heparinase II/III-like  28.96 
 
 		 581 aa  169  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.379483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4781  heparinase II/III family protein  30.1 
 
 		 596 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1942  heparinase II/III family protein  30.27 
 
 		 575 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0105  heparinase II/III-like  30.56 
 
 		 628 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3032  heparinase II/III family protein  31.02 
 
 		 572 aa  156  9e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.310136 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2927  heparinase II/III family protein  31.51 
 
 		 565 aa  124  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298148  normal  0.0379947 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2764  heparinase II/III family protein  31.06 
 
 		 567 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2719  heparinase II/III family protein  28.51 
 
 		 549 aa  119  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451444  normal  0.809272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1101  hypothetical protein  30.87 
 
 		 567 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0809  heparinase II/III family protein  27.6 
 
 		 547 aa  98.6  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00700  hypothetical protein  25.2 
 
 		 541 aa  91.3  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0392  Heparinase II/III family protein  26.57 
 
 		 557 aa  84  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.276932  normal  0.686057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23430  putative heparinase  28.74 
 
 		 550 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000712421  hitchhiker  0.00765921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1501  heparinase II/III-like  25.16 
 
 		 561 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4069  Heparinase II/III family protein  24.91 
 
 		 545 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1686  heparinase II/III family protein  30.29 
 
 		 594 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3329  heparinase II/III family protein  31.89 
 
 		 528 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1300  heparinase II/III-like  27.95 
 
 		 680 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3884  heparinase II/III family protein  29.12 
 
 		 617 aa  54.7  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0083  Heparinase II/III family protein  20.66 
 
 		 603 aa  54.7  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.137335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2158  heparinase II/III family protein  27.48 
 
 		 587 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>