More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5113 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0769  ABC-1 domain protein  75.55 
 
 		 543 aa  845    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.477502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1333  ABC-1 domain protein  75.37 
 
 		 543 aa  844    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1021  hypothetical protein  75.55 
 
 		 556 aa  844    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.396117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3020  hypothetical protein  96.88 
 
 		 544 aa  1057    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3415  hypothetical protein  75.55 
 
 		 560 aa  803    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5113  ABC-1 domain protein  100 
 
 		 544 aa  1089    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2799  hypothetical protein  45.76 
 
 		 546 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0199828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0324  ABC-1 domain protein  42.53 
 
 		 581 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2071  ABC-1 domain protein  41.67 
 
 		 581 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0987216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1129  hypothetical protein  44.32 
 
 		 586 aa  432  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.755278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2852  ubiquinone biosynthesis protein  41.59 
 
 		 559 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1871  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  41.44 
 
 		 568 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5555  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.41 
 
 		 584 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1474  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.08 
 
 		 561 aa  409  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.604813 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1807  hypothetical protein  41.23 
 
 		 560 aa  404  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4176  hypothetical protein  43.2 
 
 		 582 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.118279  normal  0.965064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0994  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.82 
 
 		 559 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.380493  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2885  ABC-1 domain protein  40.42 
 
 		 582 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2519  hypothetical protein  41.42 
 
 		 582 aa  395  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.416254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0017  2-octaprenylphenol hydroxylase  42.63 
 
 		 592 aa  395  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1598  hypothetical protein  39.34 
 
 		 591 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429743  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00151  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.71 
 
 		 558 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0390  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.92 
 
 		 559 aa  363  3e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5397  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.41 
 
 		 501 aa  359  7e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4764  2-octaprenylphenol hydroxylase  43.2 
 
 		 501 aa  336  5.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.102687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1088  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  34.48 
 
 		 561 aa  320  6e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0289446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0760  2-octaprenylphenol hydroxylase  34.66 
 
 		 561 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1388  hypothetical protein  33.76 
 
 		 561 aa  316  7e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000298772  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0902  ABC-1 domain protein  34.06 
 
 		 560 aa  315  9e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3359  ABC-1 domain protein  34.19 
 
 		 560 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.779537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2342  ubiquinone biosynthesis protein AarF, putative  33.52 
 
 		 563 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000602733  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1110  ABC-1 domain protein  34.44 
 
 		 599 aa  304  3.0000000000000004e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1733  hypothetical protein  34.9 
 
 		 557 aa  294  3e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00187554  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0342  ABC1 family protein  35.09 
 
 		 551 aa  291  3e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5398  hypothetical protein  44.94 
 
 		 538 aa  290  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.61189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1648  2-octaprenylphenol hydroxylase  31.5 
 
 		 559 aa  288  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0647  hypothetical protein  32.61 
 
 		 565 aa  288  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3956  ABC-1 domain protein  34.19 
 
 		 552 aa  287  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0295  ABC-1 domain protein  32.22 
 
 		 558 aa  283  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  29.83 
 
 		 558 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2578  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.37 
 
 		 559 aa  280  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.152488  normal  0.0679255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  29.72 
 
 		 558 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2586  ABC-1 domain protein  34.52 
 
 		 562 aa  270  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1612  ABC-1 domain protein  31.43 
 
 		 557 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.504596  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2205  hypothetical protein  35.79 
 
 		 552 aa  269  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1005  hypothetical protein  30.91 
 
 		 564 aa  263  4.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0249187 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1207  ABC transporter  31.33 
 
 		 556 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.694462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0233  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.07 
 
 		 554 aa  262  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  33.59 
 
 		 557 aa  258  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0240  ABC-1 domain protein  37.56 
 
 		 544 aa  258  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.65 
 
 		 551 aa  256  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0825  ABC-1 domain protein  29.3 
 
 		 558 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  33.59 
 
 		 557 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2561  ABC-1 domain protein  30.97 
 
 		 558 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0719  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.71 
 
 		 509 aa  253  5.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  33.74 
 
 		 557 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2664  2-octaprenylphenol hydroxylase  29.15 
 
 		 573 aa  253  8.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.948881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0578  hypothetical protein  35.16 
 
 		 560 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12230  2-octaprenylphenol hydroxylase  27.21 
 
 		 559 aa  251  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1536  ABC-1 domain protein  35.86 
 
 		 556 aa  252  2e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3247  ABC-1 domain protein  30.69 
 
 		 558 aa  251  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000474003  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3425  hypothetical protein  32.62 
 
 		 563 aa  249  8e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.416231  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3377  ABC-1 domain protein  34.17 
 
 		 557 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118171 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  35.11 
 
 		 542 aa  248  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15860  predicted unusual protein kinase  34 
 
 		 550 aa  247  4.9999999999999997e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  32.82 
 
 		 559 aa  246  9e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02769  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.95 
 
 		 557 aa  243  9e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0841  ABC-1 domain-containing protein  34.42 
 
 		 652 aa  240  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3869  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.05 
 
 		 506 aa  239  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.03 
 
 		 525 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.03 
 
 		 525 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  35.11 
 
 		 522 aa  239  8e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0631  hypothetical protein  33.99 
 
 		 558 aa  239  9e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0696  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  32.5 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.04 
 
 		 547 aa  238  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5305  ABC-1 domain protein  32.3 
 
 		 565 aa  238  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.5 
 
 		 552 aa  238  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1693  ABC-1 domain protein  32.3 
 
 		 565 aa  238  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.32 
 
 		 552 aa  237  4e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  34.67 
 
 		 525 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1843  hypothetical protein  32.04 
 
 		 549 aa  233  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295975  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.6 
 
 		 522 aa  233  5e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0626  ABC-1 domain protein  30.86 
 
 		 585 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  33.92 
 
 		 553 aa  233  6e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  33.12 
 
 		 504 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2950  ABC-1 domain protein  30.11 
 
 		 549 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1973  ABC-1 domain protein  29.57 
 
 		 547 aa  232  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.921372  normal  0.103811 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0868  hypothetical protein  32.95 
 
 		 582 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000924249  normal  0.0678292 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0856  hypothetical protein  32.67 
 
 		 555 aa  231  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1464  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  34.03 
 
 		 555 aa  231  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00546242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  37.38 
 
 		 527 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2537  hypothetical protein  29.1 
 
 		 537 aa  230  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  36.8 
 
 		 533 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.8 
 
 		 533 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.97 
 
 		 540 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2852  hypothetical protein  29.1 
 
 		 537 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.28 
 
 		 547 aa  229  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  31.54 
 
 		 543 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  31.8 
 
 		 544 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  32.19 
 
 		 549 aa  228  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>