25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5094 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5094  RecT protein  100 
 
 		 320 aa  651    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713826  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2507  RecT protein  91.85 
 
 		 318 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4075  RecT protein  79.44 
 
 		 312 aa  475  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2699  rect protein  48.79 
 
 		 294 aa  223  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.497074  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1472  recombination and repair protein RecT  42.03 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.515262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0604  recombination and repair protein RecT  41.38 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2617  recombination and repair protein RecT  37.56 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000206281  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2295  RecT protein  37.32 
 
 		 269 aa  126  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133363  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01326  recombination and repair protein  37.32 
 
 		 269 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01336  hypothetical protein  37.32 
 
 		 269 aa  126  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1851  RecT protein  31.95 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0204847  decreased coverage  0.000000000311645 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1382  recombination and repair protein RecT  34.78 
 
 		 276 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000254024 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7123  RecT protein  30.3 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0610415  hitchhiker  0.000150871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3586  hypothetical protein  77.42 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0283  RecT family protein  29.88 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4070  RecT protein  35.85 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0866384  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0320  RecT protein  30.95 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0329  RecT protein  30.95 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2078  RecT protein  30.95 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2041  RecT protein  30.95 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4008  RecT protein  26.78 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1916  RecT protein  27.32 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.427469  hitchhiker  0.0000000000811142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3047  RecT protein  26.14 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00571481  normal  0.0332137 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1674  recombinational DNA repair protein (RecE pathway)  27.54 
 
 		 310 aa  54.3  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0811  RecT protein  27.4 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.481078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>