57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5067 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  100 
 
 		 659 aa  1330    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  54.99 
 
 		 661 aa  673    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  96.51 
 
 		 659 aa  1288    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  54.99 
 
 		 661 aa  673    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  59.39 
 
 		 649 aa  743    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  44.63 
 
 		 646 aa  506  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  43.37 
 
 		 645 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  43.37 
 
 		 645 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  43.37 
 
 		 645 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  43.7 
 
 		 446 aa  346  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  44.51 
 
 		 469 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  40 
 
 		 431 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  54.4 
 
 		 206 aa  202  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0958  putative major phage head protein/prohead proteinase  34.05 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0701578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2974  putative major phage head protein/prohead proteinase  32.53 
 
 		 360 aa  159  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  44.81 
 
 		 525 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1641  prohead protease  41.8 
 
 		 197 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.627569  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2184  peptidase U35, phage prohead HK97  44.62 
 
 		 177 aa  147  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000692792 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  26.02 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  26.93 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  24.53 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  25.57 
 
 		 437 aa  77  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  28.43 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0562  hypothetical protein  23.92 
 
 		 472 aa  70.1  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.123092  hitchhiker  0.000000108718 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  30.3 
 
 		 228 aa  66.6  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  31.91 
 
 		 172 aa  64.7  0.000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  25.63 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  32.91 
 
 		 240 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  35.03 
 
 		 168 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  30.07 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  30.07 
 
 		 624 aa  57.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  26.14 
 
 		 624 aa  57.4  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  25.95 
 
 		 416 aa  57  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  30.07 
 
 		 624 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  32.48 
 
 		 171 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  23.31 
 
 		 444 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0566  peptidase U35 phage prohead HK97  30.77 
 
 		 218 aa  55.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0319239  hitchhiker  0.0000000000000124993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  25.28 
 
 		 579 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  22.57 
 
 		 279 aa  53.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  30.67 
 
 		 228 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  29.23 
 
 		 177 aa  52  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3395  HK97 family phage prohead protease  31.75 
 
 		 236 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.296315  hitchhiker  0.00000000423537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  28.76 
 
 		 244 aa  51.6  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  28.75 
 
 		 177 aa  51.2  0.00006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  31.47 
 
 		 165 aa  51.2  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  30.4 
 
 		 189 aa  50.8  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2490  peptidase U35, phage prohead HK97  32.33 
 
 		 165 aa  51.2  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.810682  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3652  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  24.53 
 
 		 393 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  28.36 
 
 		 177 aa  46.6  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2996  prohead peptidase  29.22 
 
 		 174 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.102454  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  35.85 
 
 		 216 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  32.11 
 
 		 231 aa  45.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1634  prohead peptidase  30.28 
 
 		 183 aa  45.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.457432  normal  0.754513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  35.85 
 
 		 216 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000250589 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1626  peptidase U35, phage prohead HK97  30.72 
 
 		 165 aa  44.3  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.468737  normal  0.616924 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1483  peptidase U35, phage prohead HK97  30.72 
 
 		 165 aa  44.3  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.332545 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2687  peptidase U35 phage prohead HK97  32.45 
 
 		 409 aa  44.3  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>