68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5047 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  82.11 
 
 
3521 aa  2455    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  69.45 
 
 
3238 aa  2620    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  96.28 
 
 
2900 aa  5564    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
2899 aa  5811    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  62.11 
 
 
3286 aa  3103    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6221  hypothetical protein  58.87 
 
 
729 aa  657    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  74.45 
 
 
3006 aa  4222    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  70.8 
 
 
2140 aa  3046    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3248  hypothetical protein  81.9 
 
 
425 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  37.99 
 
 
1100 aa  486  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  37.52 
 
 
1051 aa  476  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  38.55 
 
 
1101 aa  466  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  38.55 
 
 
1092 aa  463  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  38.09 
 
 
1133 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  36.12 
 
 
1543 aa  458  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  35.66 
 
 
1219 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  37.01 
 
 
1103 aa  422  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  35.66 
 
 
1221 aa  420  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  34.14 
 
 
1061 aa  408  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  34.27 
 
 
1067 aa  407  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  34.07 
 
 
1341 aa  407  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  33.24 
 
 
1816 aa  404  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  39.33 
 
 
1120 aa  400  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  39.17 
 
 
1120 aa  397  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  35.34 
 
 
1116 aa  393  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  35.33 
 
 
1116 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  33.86 
 
 
1188 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  35.6 
 
 
1159 aa  389  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  35.78 
 
 
1137 aa  389  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  35.37 
 
 
1132 aa  385  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  36.82 
 
 
1158 aa  386  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  36.82 
 
 
1158 aa  386  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  36.87 
 
 
1157 aa  387  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  35.6 
 
 
1132 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  35.6 
 
 
1132 aa  385  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  35.33 
 
 
1159 aa  387  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  32.82 
 
 
1057 aa  387  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  33.87 
 
 
1194 aa  380  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  36.33 
 
 
1159 aa  376  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  36.33 
 
 
1159 aa  377  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  35.92 
 
 
1157 aa  371  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  38.28 
 
 
1157 aa  370  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  32.31 
 
 
2007 aa  355  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  39.42 
 
 
522 aa  336  4e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  31.49 
 
 
1059 aa  333  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  36.88 
 
 
1012 aa  323  3.9999999999999996e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3247  hypothetical protein  61.72 
 
 
287 aa  305  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  35.21 
 
 
881 aa  225  9.999999999999999e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  38.17 
 
 
951 aa  198  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  33.92 
 
 
837 aa  161  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  26.34 
 
 
960 aa  149  7.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  26.34 
 
 
1564 aa  134  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  25.31 
 
 
2196 aa  134  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  24.96 
 
 
1171 aa  89.4  9e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1315  Hedgehog/intein hint domain protein  30.91 
 
 
1115 aa  79.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  22.54 
 
 
1644 aa  77.4  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  23.79 
 
 
918 aa  75.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3558  hypothetical protein  27.92 
 
 
1172 aa  65.5  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1851  hypothetical protein  28.87 
 
 
270 aa  59.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459823  normal  0.905068 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3499  hypothetical protein  33.58 
 
 
833 aa  58.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1315  hypothetical protein  28.5 
 
 
702 aa  52.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3893  hypothetical protein  36.05 
 
 
762 aa  50.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1270  hypothetical protein  36.05 
 
 
762 aa  50.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1764  hypothetical protein  31.33 
 
 
771 aa  49.7  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0992615  normal  0.125596 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  32.91 
 
 
1351 aa  48.9  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1850  hypothetical protein  27.04 
 
 
417 aa  48.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0064  hypothetical protein  32.71 
 
 
763 aa  46.6  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00226293  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5439  hypothetical protein  24.04 
 
 
1172 aa  46.2  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.861943  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>