More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5019 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  100 
 
 		 344 aa  714    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  74.93 
 
 		 345 aa  555  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2742  Integrase catalytic region  72.89 
 
 		 352 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0453535  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2426  Integrase catalytic region  72.89 
 
 		 352 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.523516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1750  Integrase catalytic region  72.89 
 
 		 352 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0900  Integrase catalytic region  72.89 
 
 		 352 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1678  Integrase catalytic region  72.89 
 
 		 352 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1724  Integrase catalytic region  72.89 
 
 		 352 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3016  Integrase catalytic region  64.33 
 
 		 353 aa  475  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  60.53 
 
 		 350 aa  461  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  60.23 
 
 		 350 aa  458  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1248  integrase catalytic subunit  59.76 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113109  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1428  integrase catalytic subunit  59.76 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1434  integrase catalytic subunit  59.76 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.522926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2096  integrase catalytic subunit  59.76 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.898918  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2098  integrase catalytic subunit  59.76 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2208  integrase catalytic subunit  59.76 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0956  hypothetical protein  58.53 
 
 		 364 aa  427  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0884  hypothetical protein  58.53 
 
 		 364 aa  427  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0934  hypothetical protein  58.53 
 
 		 364 aa  427  1e-118  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0345872 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2033  hypothetical protein  58.04 
 
 		 344 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3543  ISSod13, transposase  57.86 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3880  ISSod13, transposase  57.86 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0119  ISSod13, transposase  57.86 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0142  ISSod13, transposase  57.86 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0151  ISSod13, transposase  57.86 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2463  Integrase catalytic region  57.57 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3580  integrase catalytic subunit  57.57 
 
 		 346 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0434  Integrase catalytic region  57.57 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2695  Integrase catalytic region  57.57 
 
 		 346 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0101379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0915  Integrase catalytic region  57.27 
 
 		 346 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.277682  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2676  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2685  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2551  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000856867  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2553  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000502236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2961  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2972  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0804741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2977  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1832  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.394112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2690  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2693  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0220  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0409  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0338  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.465639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0589  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.02075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0586  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0674484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0919  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.608605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0823  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2708  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1220  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2889  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0567202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1821  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.304505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1479  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1400  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000187237  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1838  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1850  Integrase catalytic region  55.69 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2149  Integrase catalytic region  55.39 
 
 		 348 aa  408  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.142732  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3940  integrase catalytic subunit  57.8 
 
 		 346 aa  409  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1763  integrase catalytic subunit  56.38 
 
 		 346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4777  integrase catalytic region  75.96 
 
 		 210 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0852  integrase catalytic subunit  43.62 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.336174  normal  0.0241758 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0877  integrase catalytic subunit  43.62 
 
 		 349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1005  Integrase catalytic region  42.43 
 
 		 349 aa  270  4e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3878  integrase catalytic subunit  38.86 
 
 		 344 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0362  integrase, catalytic region  36.86 
 
 		 337 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.540687  hitchhiker  0.0000859615 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4480  integrase, catalytic region  36.86 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000214093 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1864  integrase catalytic subunit  38.86 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2262  integrase catalytic subunit  38.86 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.512462  normal  0.657223 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3186  integrase catalytic subunit  38.86 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3191  integrase catalytic subunit  38.86 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3733  integrase catalytic subunit  38.86 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1966  ISSod13, transposase  39.78 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00452  predicted DNA-binding transcriptional regulator  51.3 
 
 		 123 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3110  conserved hypothetical protein  51.3 
 
 		 123 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00457  hypothetical protein  51.3 
 
 		 123 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0553  putative transposase  66.23 
 
 		 107 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0575438  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0627  integrase, catalytic region  66.15 
 
 		 95 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000721298  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2051  ChnZ  66.15 
 
 		 95 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7487  putative transposase  89.58 
 
 		 53 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17960  integrase family protein  35.9 
 
 		 422 aa  90.9  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  0.82846 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3007  hypothetical protein  34.27 
 
 		 193 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3736  transposase  35.76 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4665  integrase, catalytic region  44.12 
 
 		 155 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.599726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01931  probable transposase protein, Y4bF  37.6 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0552  hypothetical protein  62.71 
 
 		 86 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000200918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24520  integrase family protein  35.1 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4847  Integrase catalytic region  31.08 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21030  Integrase, catalytic domain-containing protein  24.51 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.436118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22320  Integrase, catalytic domain-containing protein  24.51 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11320  Integrase, catalytic domain-containing protein  24.51 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09100  Integrase, catalytic domain-containing protein  24.51 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.387294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33550  transposase  24.51 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15790  Integrase, catalytic domain-containing protein  24.51 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50600  transposase  24.51 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1456  Integrase catalytic region  28.94 
 
 		 394 aa  73.9  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0615  integrase catalytic subunit  29.26 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.503293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3364  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5595  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2520  integrase catalytic region  25.15 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1778  integrase catalytic subunit  29.51 
 
 		 426 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.12662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>