More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4952 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  100 
 
 		 121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  88.43 
 
 		 121 aa  214  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  77 
 
 		 121 aa  159  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  64.75 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  63.11 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  61.34 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  61.34 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  71.88 
 
 		 115 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  72.92 
 
 		 124 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  73.4 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  66.3 
 
 		 358 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  72.5 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  62.26 
 
 		 199 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  63.89 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  65.59 
 
 		 242 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  60 
 
 		 360 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  65.59 
 
 		 242 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  60 
 
 		 360 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  65.59 
 
 		 230 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  65.59 
 
 		 230 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  65.59 
 
 		 211 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  62.26 
 
 		 335 aa  127  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  65.59 
 
 		 211 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  65.59 
 
 		 211 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  55.75 
 
 		 168 aa  126  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  64.44 
 
 		 163 aa  126  9.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  65.93 
 
 		 367 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  63.44 
 
 		 211 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 200 aa  124  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  59.6 
 
 		 342 aa  122  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  62.37 
 
 		 202 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  65.59 
 
 		 200 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  57.26 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  61.54 
 
 		 170 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 238 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  64.52 
 
 		 212 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  56.41 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  62.37 
 
 		 199 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  52.54 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 203 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 203 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 203 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  56.67 
 
 		 167 aa  117  6e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  58.06 
 
 		 198 aa  117  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  54.55 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 213 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  56.41 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 371 aa  116  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  66.67 
 
 		 157 aa  115  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1705  rare lipoprotein A  60.64 
 
 		 367 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4287  rare lipoprotein A  61.8 
 
 		 94 aa  115  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.7858 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  63.74 
 
 		 134 aa  115  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  61.29 
 
 		 213 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  48.31 
 
 		 261 aa  115  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5916  rare lipoprotein A  61.05 
 
 		 303 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  60.22 
 
 		 214 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  57.61 
 
 		 213 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  61.11 
 
 		 165 aa  114  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  54.05 
 
 		 227 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  60 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  59.78 
 
 		 196 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  48.18 
 
 		 127 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  56.52 
 
 		 239 aa  113  7.999999999999999e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  54.95 
 
 		 243 aa  113  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3341  putative lipoprotein  57.14 
 
 		 230 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0362998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  56.52 
 
 		 179 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  57 
 
 		 221 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  59.34 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0655  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 279 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0270867  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  54.29 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2271  rare lipoprotein A  59.26 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  51.28 
 
 		 124 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  58.89 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2527  rare lipoprotein A  47.93 
 
 		 214 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00936406  normal  0.0858396 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  61.25 
 
 		 175 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0928  lipoprotein A family protein  54.84 
 
 		 206 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 282 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1486  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 206 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.72104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  52.13 
 
 		 186 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  55.56 
 
 		 262 aa  109  1.0000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  65.22 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  50.98 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  56.99 
 
 		 322 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  47.54 
 
 		 139 aa  107  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3267  rare lipoprotein A  53.92 
 
 		 247 aa  107  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3528  putative lipoprotein  56.52 
 
 		 331 aa  107  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2675  rare lipoprotein A  54.84 
 
 		 249 aa  107  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  58.95 
 
 		 125 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4116  rare lipoprotein A  56.04 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000656887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1224  lipoproteins  50 
 
 		 254 aa  107  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  58.51 
 
 		 125 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  60.67 
 
 		 140 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  60.87 
 
 		 142 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3972  rare lipoprotein A  55.91 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0134475  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4323  rare lipoprotein A  50.98 
 
 		 314 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  58.24 
 
 		 238 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  48.54 
 
 		 131 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  52.69 
 
 		 240 aa  106  8.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3338  sugar fermentation stimulation protein  59.49 
 
 		 297 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000024991  normal  0.0181355 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  52.34 
 
 		 181 aa  106  9.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>